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转载 samtools使用方法参数整理

samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtmlsamtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。包含有许多命令。以下是常用命令的介绍1. viewview命令的主要功能是:将sam文件转换成bam文件;然后对bam文件进行各种操作,比如数据的排序(不属于本命令的功能)和提取(这些操作 是对bam

2017-08-23 18:55:14 5247 1

转载 CO-IP技术详解

最近在不同技术论坛上溜达加上客户的来电咨询,发现 Co-IP 免疫共沉淀的实验小伙伴做得并不是很顺利,遇到的问题也是千奇百怪,有什么条带也没有检测到的,有泳道一片漆黑的,有出了条带但位置大小还不对,真是让小伙伴们伤透了脑筋,万变不离其踪,做实验之前我们先系统地的了解一下实验各个环节的一些基本概念和注意事项,以及如何设置完整的对照以便出问题时快速分析原因。免疫共沉淀实验原理介绍:免疫

2017-08-18 10:34:44 18334

转载 梯度下降函数理解

r(d)可以理解为有d的参数进行约束,或者 D 向量有d个维度。咱们将楼主的给的凸优化结构细化一点,别搞得那么抽象,不好解释; , 其中,咱们可以令: f() =.ok,这个先介绍到这里,至于f(x)为什么用多项式的方式去模拟?相信也是很多人的疑问,很简单,大家看看高等数学当中的泰勒展开式就行了,任何函数都可以用多项式的方式去趋近,log x,lnx,等等都可以去趋近,而不

2017-08-11 10:26:22 1094

转载 Python机器学习 scikit-learn机器学习库

阅读目录1. scikit-learn介绍2. scikit-learn安装3. scikit-learn载入数据集4. scikit-learn学习和预测5. 总结6. 参考内容回到顶部1. scikit-learn介绍  scikit-learn是Python的一个开源机器学习模块,它建立在NumPy,SciPy和matplotlib

2017-08-09 11:53:59 1037

转载 R做圈图

http://www.cnblogs.com/1zhk/p/4762061.html

2017-08-08 20:39:13 1733

原创 TCGA rsem 计算

#################################准备对应物种index文件rsem-prepare-reference --gtf Macaca_mulatta.MMUL_1.85.chr_fixed.gtf --bowtie-path /usr/bin Macaca_mulatta.MMUL_1.dna.toplevel.fa RSEM.index###########

2016-10-27 16:44:22 2091

空空如也

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