CESM笔记——env_run.xml设置

在运行模式工作流中，修改env_run.xml是submit前的一个步骤。

这里来介绍一下env_run.xml里面的设置。

参考这个PPT：http://www.cesm.ucar.edu/events/tutorials/2019/files/Practical2-shields.pdf

基础变量：

1.RESUBMIT: 设置重新提交的次数

2. STOP_OPTION:设置运行时间间隔的类型，i.e. nmonths, ndays, nyears或者其他特定日期类型 

3. STOP_N：设置在指定的wallclock时间运行模式的时间间隔数（按stop_option指定的单位）。Wallclock时间在*.run文件中设置，是实际时间的度量。(wallclock time字面意思就是挂钟时间，即现实中的时间，wallclock time vs. cpu time)

***STOP_OPTION和STOP_N控制每个计算机作业提交运行的时间长度。典型的一次模拟需要进行多次作业提交才能完成。（一般的作业任务只能在计算机队列中停留指定的时间，而这个队列时间限制通常比需要的完成一次模拟时间要短。）

问题：假设一个实验模式运行速度为10yrs/d，每次允许的最大队列时间为12h-wallclock time，如果要跑100年的实验，RESUBMIT, STOP_OPTION, STOP_N怎么设置？

回答：假设每天提交两次（2，12-h jobs）,模式运行速度10年/天，则每次作业提交跑10/2=5年。

即STOP_OPTION=nyears, STOP_N=5,RESUBMIT=19

initial run of 5yrs+(19 resubmits*5yrs)=100 yrs

4. CONTINUE_RUN: 如果是TRUE,表示是continue_run。如果RESUBMIT>0并且是initial run(i.e. CONTINUE_RUN=FALSE), CONTINUE_RUN会在initial run完成后更新到TRUE。

5. INFO_DBUG: 设置标准输出声明，如果需要debugging，就需要一个更大的值。

6. DOUT_S: 开启短期存档，默认为TRUE。

7. HIST_OPTION: 耦合器（“驱动程序”）历史文件规范。注意：所有其他模式组分在model component namelists中指定历史文件信息。

8. CCSM_CO2_PPMV: CO2值会被传输到POP和CLM中（如果CO2为定值）

 

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run_type相关变量：

1.RUN_TYPE: 初始化设置，有startup, hybrid, branch三种可选

startup: 所有模式组分从初始默认条件开始初始化

hybrid:

-大气模块，使用用户指定模拟中的初始条件文件开始初始化

-陆地、海洋和海冰，使用用户指定模拟中的restart文件开始初始化

-不需要耦合文件

-初始条件和restart文件使用相同的参考案例（reference case）和参考时间(reference date)

branch:所有模式组分从用户指定模拟中的初始条件文件开始初始化

hybrid vs. branch

如果我们要跑一个和控制实验（control run）仅有些微差别的实验，比如我们只是想做一些微小调整，增加历史输出（history output)，或者从一个CESM spun-up的初始态来开始模拟并保持精确的重新启动（restart）（这模仿了模式在原始设置中继续运行时的操作），在这些情况下，hybrid和branch runs非常有用。

使用hybrid run: 对于大多数不需要逐位重新启动(bit for bit restart)的应用。可以为模式运行指定新的开始日期。

使用branch run:仅适用于需要完全重新启动的应用。不能为模型运行指定新的开始日期。它将由参考案例分配（run_refdate）。（例如，如果要在运行期间更改历史输出流，则需要使用branch）。

2. RUN_REFCASE: 如果是branch/hybrid, 则指定模式继续运行的case名称。

3. RUN_REFDATE: 日期戳，指导参考案例的开始时间。（startdate相当于现在当前模拟的开始时间，refdate是reference case的开始时间，我目前是这么理解的？）

4. GET_REFCASE: default=TRUE；如果是TRUE，数据需要预先暂存在可执行目录中（这与去年的CESM2.0不同）。