【算法设计与分析】动态规划:最长公共子序列

本文通过一个DNA比对的例子,介绍了如何使用动态规划策略找到两个基因片段的最长公共子序列。首先分析了问题的最优子结构,并给出最优值的递归定义。接着,详细阐述了算法实现过程,包括lcsLength和lcs两个函数,并展示了基因比对的结果。最后,讨论了算法的时间复杂性,lcsLength的时间复杂度为O(mn),而lcs的时间复杂度为O(m+n)。
摘要由CSDN通过智能技术生成

A先生找到了其失散多年的兄弟。为了确定血缘关系,A先生决定做DNA鉴定。请编写程序,比较两组基因,A先生基因片段为{A,C,T,C,C,T,A,G}, A先生兄弟基因片段为{C,A,T,T,C,A,G,C},找出两人基因片段中最长相同的部分(最长公共子序列)。采用动态规划策略解决该问题。
1)分析问题的最优子结构性质,写出最优值递归定义。
0, i= 0或j = 0
c[i][j] = { c[i-1][j-1]+1, i,j > 0和 =
max{c[i-1][j],c[i][j-1]}, i,j > 0和 ≠

2)将算法编程实现并给出基因比对结果。

package eight;

public class today {
   
	static char[] x = {
   'A','C','T','C','C','T','A','G'};
	static char[] y = {
   'C','A','T','T','C','A','G','C'};
	static int m = x.length , n = y.length;
	
	static int[][] b = new int[m+1][n+1];
	
	public static void main
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