医疗图像读取包引发的乌龙事件

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做实验室项目发生的事情:

nibabel读出来的3D数据顺序为(x,y,z)

然后调用的函数把nibabel读出来的数据转置了一下,(z,y,x)

simple itk 读出来的3D数据的顺序为(z,x,y)

因为这两个读出来的轴的顺序不一样,我写了一个bug出来,花了一个半小时才调完。

经验教训,调试用的数据不能随便更换,否则会多调试半个小时。

今天还学到一招,

在pycharm中,可以通过

cv2.imshow()

cv2.waitkey(0)

assert False

来观察输出结果。

 

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2019.05.10更新

感觉simple itk 读出来的顺序是 (z,y,x)

 

而nibabel 的确还是 (x,y,z)

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