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原创 分清TCGA中的冷冻切片和福尔马林固定-石蜡包埋切片

TCGA提供两种类型的载玻片,即快速冷冻和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)1)其中带有“TS#”或“BS#”的文件(其中#是整数)是冻结的幻灯片,如下所示:TCGA-CH-5765-11A-01-TS1.2a1faf76-526b-4581-b947-e8d733674df7.svs2)使用“DX#”的文件(其中#是整数),是FFPE幻灯片:TCGA-14-0786-01Z-0...

2019-05-28 11:55:32 3161

原创 window10安装scikit-survival

问题:想安装scikit-survival,在anaconda上没有找到可以直接下载的安装包,只能通过命令来下载。尝试:使用pip install scikit-survival命令下载报错:UnicodeDecodeError: 'gbk' codec can't decode byte 0x93 in position 1737: illegal multibyte sequ...

2019-05-07 15:03:13 803 2

原创 R语言:使用SMOTE出现错误

错误1、“length of 'dimnames' [2] not equal to array extent”我的原代码:balanceData <- SMOTE(status~.,selecData,perc.over=500,perc.under=100)错误原因是将tibble数据结构传入了DMwR::SMOTE(),使用as.data.frame()将数据un-tib...

2018-12-03 22:38:12 8087 1

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