GWAVA

最新推荐文章于 2024-05-26 08:31:33 发布
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分类专栏： 生物信息学 文章标签： GWAVA
原文链接：https://www.itengying.com/articles/996057d7bc0d85
版权

GWAVA

https://www.sanger.ac.uk/

sanger/StatGen_Gwava

文献 Nat Methods. 2014 Mar; 11(3): 294–296.

首选推荐这个是因为

GWAVA可以预测非编码区的突变

此方法考虑了

开放染色质数据，转录因子结合数据

距离TSS远近，组蛋白修饰

CpG岛数据等等作为参考

来给非编码区的突变打分

得到三个层面的score

Regionscore

TSSscore

Unmatchedscore

大致来说

分数越高

突变可能有功能的概率越大

具体可参见原始论文

hello~bye~
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