Mysql 运行原理 (1) - InnoDB 数据存储结构

此系列博客为学习笔记,B 站原视频地址。某些更加具体细节可能会有遗漏,主要目的在于理解 mysql 整体的运行原理。后面博客如果没有特殊说明,都采用 Mysql 5.7 版本。

本文主要介绍,Mysql 中的 InnoDB 存储引擎是如何在磁盘中存储表数据,又通过什么样的存储结构进行存储。

表空间

Mysql 5.7 版本,每当我们创建一个新的表,都会分别创建两个文件:

Mysql5.7表空间

不过 Mysql 5.7- 版本,所有表的数据以及索引数据都存储在一个文件中:系统表空间/共享表空间。

可以通过以下 SQL 设置存储方式:

# 开启独立表空间,即为每个表都创建 ibd 文件
SET GLOBAL innodb_file_per_table = 'ON';

# 查看是否开启独立表空间
SHOW VARIABLES LIKE 'innodb_file_per_table'

并且 Mysql 5.8 版本:已经将 frm 文件合并到了 ibd 文件中。

下面我们新建一张表,进行测试:

CREATE TABLE `user` (
	`id` 				 BIGINT ( 20 ) UNSIGNED NOT NULL AUTO_INCREMENT COMMENT '主键',
	`user_id` 	 BIGINT ( 20 ) UNSIGNED NOT NULL COMMENT '业务主键',
	`name` 			 VARCHAR ( 100 ) NOT NULL COMMENT '名称',
	`created_by` BIGINT ( 20 ) DEFAULT NULL COMMENT '创建人',
	`created_at` datetime DEFAULT NULL COMMENT '创建时间',
	`deleted` 	 TINYINT ( 1 ) UNSIGNED DEFAULT '0' COMMENT '是否删除(1.Y 0.N)',
	PRIMARY KEY ( `id` ) USING BTREE,
    UNIQUE KEY `uk_user_id` ( `user_id` ) COMMENT '业务主键唯一索引' 
) ENGINE = INNODB DEFAULT CHARSET = utf8mb4 COMMENT = '用户表';

查看一下表在本地的存储位置:

# D:\development\mysql-5.7.38-winx64\data\
SHOW VARIABLES LIKE '%datadir%';

表空间data目录

表空间表文件

可见实际上,每个数据库在磁盘中是一个目录,而表则分为 table.ibd、table.frm 文件。表内的所有数据最终都存储在 ibd 文件中。

除了独立表空间还有其他类别的表空间,总计可分为五种:

表空间的分类

独立表空间:ibd 文件

ibd 文件是表数据存储的核心文件,下面就分析一下该文件中是如何组织存储数据的。

页 PAGE

页是最基础的存储单元,也是 InnoDB 在磁盘与内存间传输数据时的基本单位。
每个页大小为固定的 16 KB,即使没有数据,也会占用 16 KB 大小。如果要调整页的大小,仍需要保证为操作系统数据块 4KB 的整数倍。这样才能保证与磁盘进行数据传输时,数据不会被分割。

根据局部性原理:当一个数据被用到时,其附近的数据也通常会被马上用到,所以页之间的地址也是连续的。只需要在磁盘中读取一段连续的数据放入内存,后续的查询大概率就可以直接在内存中找到。这样就可以减少与硬盘的 IO 次数。

页的传输交互

页的分类有12种之多,但无论什么页,都会包含 File header 与 File tailer。并且,根据类别的不同,会在中间的主体部分存储不同的数据:

页结构

最为常见的是存储实际数据或索引数据的索引页,主体部分大多存储的为数据行:

索引页

下面以索引页为例,逐一拆分说明各行都存储了什么信息。

页头与页尾行

IndexPage-File header & File tailer

File header

  1. 页号、上页页号、下页页号:通过这三个字段,可以将多个页组成一个双向链表,保持页之间的连续性,即使在物理磁盘中不是连续的。
  2. 页类型:类型的标识字段,比如索引页的类型则为:FIL_PAGE_INDEX / 0x45BF
  3. 表空间 ID:表空间的 ID 值
  4. 校验和:用来做数据的完整性校验
  5. 最近一次修改的 LSN、已被刷到磁盘的 LSN:日志序列号

File tailer

  1. 校验和:与 File header 中的校验和相对应
  2. 最近一次修改的 LSN:日志序列号

校验和的作用:一个页的固定大小为 16KB,操作系统传输单元数据块为 4KB。也就是说,当我们传输时一个页的数据时,若发生断电情况就会导致部分页的数据块传输失败,进而导致页数据丢失。这时就需要用页头、尾中的 校验和 字段通过验证算法进行完整性校验,默认使用 crc32 算法。

校验算法可以通过 SQL 进行查看:

SHOW VARIABLES LIKE '%innodb_checksum_algorithm%';
数据行 ROW

对比页固定的 16KB 大小,行的大小不是固定的,最大为 8 KB 大小。表中的每条数据,本质上就是对应页中的数据行。在 mysql 5.7 默认行的格式为 dynamic。

Dynamic format row

Dynamic format row

头信息中的字段:

  1. 下一行地址:next_record
  2. 行类型:record_type
  3. 记录堆位置:heap_no
  4. 行组数:n_owned
  5. 为层最小值:min_rec_mask
  6. 删除标记:delete_mask

真实数据区字段:

  1. 主键值字段:Primary key 主键值

    • 如果是复合主键,也会依序排在这里
    • 如果没有主键,会优先使用一个不为 NULL 的 UNIQUE 唯一列作为主键
    • 如果以上都没有,InnoDB 会构建一个 6 Byte 的叫做 DB_ROW_ID 行唯一表示字段替换主键字段。
  2. 事务运行中的核心字段:

    • DB_TX_ID:事务 id
    • DB_ROLL_PTR:事务回滚指针
  3. 列字段:存储的真实的表列数据,从左到右依次排放,但不包含主键列以及值为 NULL 的列(原因在讲解 NULL 值字段列表字段时会说明)。

额外信息区字段:

  1. 头信息字段:

    1. 下一行地址:next_record,前16位,存储下一行真实数据的起始地址。这样做的好处是,向右移动即是下一行的真实数据,向左移动则是下一行的头信息,无需额外的长度计算。且通过该字段可将所有行组成一个单向链表。
    2. 行类型:record_type,包含四种类型 0:普通数据行 1:索引目录行 2:页内最小行Infimun 3:页内最大行Supermun
    3. 位置:heap_no,该行在页中的位置
    4. 组行数:如果当前行是行分组中的最后一行,该 4bit 会记录分组的行数。这样可以快速查询行数,不用在行组遍历累加计算了。(行分组会在本文的后面说明)
    5. 为层最小值:B+索引树每层的最小值标记。如果当前行为当前索引层的最小值,且为索引目录行,则置为1,方便索引查询。
    6. 删除标记:delete_mask,当行数据被删除后,不会立即移除,而是置该位为1。并将 next_record 位改为 0。
      然后进行单向链表结点删除时的指针更新:上一行的 next_record 指向当前行的下一行地址,将当前行从链表中断开。
      当事务提交后,在讲该行的 next_record 指向一个称为垃圾链表的地方。这个链表被用于事物会滚中,事务后面的博客会进行讲解。
  2. NULL值字段列表:将可为 NULL 的字段,从右至左的顺序,各用一个 bit 标识是否为 NULL,节省存储空间。所以实际上当字段值为 NULL 时是不会在真实数据区存储该列为 NULL 的。不足 8bit 则用 0 补齐,超过 8bit 则在申请 8 bit。

  3. 可变字段长度列表:记录可变长度字段的真实长度,存储顺序为字段从右至左。这样方便在真实数据区域对字段值进行分割。使用 2 Byte 存储真实数据大小,2 Byte 最多可表示:2^16 = 65535 Byte。按照最大长度字符集中每个字符的长度最多为 4 Byte 来算,最多可表示 65535 / 4 = 16383 个字符。mysql 5.7 版本中 varchar 长度上限 16383 就是根据这个计算得出的。常见可变长度字段类型:

    1. varchar
    2. varbinary
    3. text
    4. blob
    5. utf-8、gkb 这样变长字符集的 char 类型

特殊情况:可变字段实际数据超过了一个页的存储容量,那么就会将数据存放到一个溢出页中,并在将溢出页的地址替换需要存储的实际数据。

可变字段的溢出特殊情况

栗子:

我们新建的 User 表中添加一条数据

CREATE TABLE `user` (
  `id` bigint(20) unsigned NOT NULL AUTO_INCREMENT COMMENT '主键',
  `user_id` bigint(20) unsigned NOT NULL COMMENT '业务主键',
  `name` varchar(100) NOT NULL COMMENT '名称',
  `created_by` bigint(20) DEFAULT NULL COMMENT '创建人',
  `created_at` datetime DEFAULT NULL COMMENT '创建时间',
  `deleted` tinyint(1) unsigned DEFAULT '0' COMMENT '是否删除(1.Y 0.N)',
  PRIMARY KEY (`id`) USING BTREE,
  UNIQUE KEY `uk_user_id` (`user_id`) COMMENT '业务主键唯一索引'
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COMMENT='用户表';

INSERT INTO `user` ( id, user_id, NAME, created_by, created_at )
VALUES (1, 111, '张三', NULL, '2023-08-10 00:00:00')

这条数据的 Dynamic format row 是什么样的呢?

Dynamic format row 的栗子

其余格式的 row

除了 dynamic 格式的行外,还有其他格式的行。数据行一共可分为四种格式,每种格式的行具有不同的特点适用不同的场景:

  1. redundant:已经被淘汰
  2. dynamic
  3. compressed:与 dynamic 的格式完全一致,但会对数据进行压缩减少空间占用
  4. compact:与 dynamic 的格式完全一致,但在处理超长字段时有一些区别。compact 格式的行不会把所有超长数据都放入 溢出页 中,而是在溢出时只保留 768 字节的溢出数据

可以根据下面的 SQL 查询表中行的类型:

SELECT t.SPACE,t.NAME,t.ROW_FORMAT FROM information_schema.INNODB_SYS_TABLESPACES t
-- name : 库名/表名
WHERE name = 'local_db/user'

在建表时也可以通过 ROW_FORMAT 参数修改表的行类型。又或可以查看、修改默认的全局行格式配置:

SHOW VARIABLES LIKE 'innodb_default_row_format'

SET 'innodb_default_row_format' = format
最小行与最大行

每当创建一个新页,都会创建两个行:

  • 固定 heap_no 为 0 且 record_type 为 2 的最小行 Infimun
  • 固定 heap_no 为 1 且 record_type 为 3 的最大行 Supermun

由于 heap 0、1 被固定占用,所以新数据行的 heap_no 都是从 2 开始。
这两个行不存储任何信息,仅是作为数据行链表的头、尾节点。
当没有真实数据时,Infimun 的 next_record 指向 Supermun。Supermun 因为永远都是尾节点,所以 next_record 一直为 0。
虽然 Infimun 与 Supermun 不存储任何数据,但是他们与数据行的结构是完全一致的。且真实数据区存储的分别为固定字符串:Infimun、Supermun。

下面是新增数据行后的链表图(新增时根据主键字段值搜索插入节点,保证行是有序的):

最小行最大行与数据行的链表

页目录行

当数据行的大小比较均匀且每个行大小较小时,一个页中可以存储的行是很多的。我们以创建过的 user 表为例,假设每个行数据都不存在列为 NULL 的情况:

name 使用 utf-8 字符集,且按照两个字符计算,8 Byte。datetime 8 Byte。tinyint 1 Byte。

一个 dynamic 数据行大小:54 Byte

额外信息区域:
可变字段列表:name 字段长度 -> 2 Byte
NULL 值字段列表:2bit 不足 8 bit 进行补齐 -> 8 bit
头信息:固定 -> 40 bit
总计:8 Byte

真实数据区域:主键 + 事务 id + 事务回滚指针 + 所有列
总计:8 Byte + 6 Byte + 7 Byte + / 8 Byte + 8 Byte + 8 Byte + 1 Byte = 46 Byte 

页头行 + 页尾行:38Byte + 8 Byte = 46 Byte
数据页头行 + 行目录:暂先不考虑

计算得可储数据行数:(16 KB - 46 Byte) / 54 Bye ≈ 595

所以我们想要在页中搜索一条数据时,时间复杂度为 O(n)。

为了提高页内搜索行的速度,引入了页目录行:将含有最小、最大行以及所有数据行的链表进行分组。约定最小行即首行单独为一组。其他组每组最多有 8 行。同时把每个组最后一行在页中的地址,按照根据主键字段升序记录到页中的页目录行。页目录中的单位为槽,每个槽对应了一个行组。

页目录示例1

当新增行后触发了组新增:

页目录示例2
为了快速判断是否组内行数是否到了 8 的阈值,会在每组最后一行的额外信息区域中的 组行数字段(n_owned)。当发现超过 8 的阈值时,会在页目录中创建一个新的槽,记录组内最后一行的地址。

这样当我们搜索一个行时就可以先二分查询页目录,找到槽后在根据槽中的行地址,最多进行 8 次查找就可以找到行数据了,将 O(n) 的时间复杂度降到了 O(log2n)。

数据页头行

为了方便操作与管理数据页,会将数据页中的一些统计、通用信息记录在数据页头中,用 56 个固定 Byte 记录:

数据页头行

区 EXTENT

ibd 文件时存储在磁盘中的,当读取数据随机性过高,需要跨多页进行数据访问,而这些页大概率分布在不同的磁道上。

所以,在物理上,就会频繁发生磁头移动磁道读取数据。相比在同一磁道上每分钟几千上万次的旋转读取,要缓慢的多。

磁头移动

为了提高随机读取磁盘页数据的性能,避免频繁的磁头移动,引入了区的概念,将多个页再次组织成区在磁盘中:

区

当区中的某个页被频繁访问时,会将整个区读取到内存中的 Buffer Pool 中,进而提高查询速度。

碎片区

我们新建一张表时,我们是不确定表的数量级的,不知道该创建多少的页才合适。为了不创建过的的页导致磁盘空间的浪费,默认的会创建 6 个页(Mysql 8 时会创建 7 个页),共计 16 KB * 6 = 96 KB。6 个页不足构成一个完整的区,新建后产生的零散的页,会被存放到表空间中的 碎片区(Base extent)。可以理解为碎片区是表中的第一个初始区。

初始的这 6 个 页并不是完全空的,会存储一些数据信息的:

初始的6个页
后两个页为空闲页,即可用页。前四个页记录了:

  1. 表空间和区组
  2. Change Buffer
  3. 段(段和区组后面会说到)
  4. 索引根

我们可以根据 SQL 查询一下新的空表的信息:

-- 查看某表的行类型
SELECT 
t.SPACE,
t.NAME,
t.ROW_FORMAT,
(t.PAGE_SIZE / 1024) AS PAGE_SIZE_KB,
(t.FILE_SIZE / 1024) AS FILE_SIZE_KB
FROM information_schema.INNODB_SYS_TABLESPACES t
-- name : 库名/表名
WHERE name = 'local_db/user'

当随着数据量的增加会产生更多的页在碎片区,当超过 32 个零散页后,就会创建新的区存储页数据。区别来了:碎片区最多存储 32 个页 即 512K,而普通的区则可以存储 64 个页,即 1MB。

区组 EXTEND GROUP

区的上一层就是区组,区组的概念十分简单:将 256 个区合并在一个组内。

区组

段 SEGMENT

段是一个逻辑概念,并不代表表空间中的一段连续物理区域。段可以理解为是页与区的一个附加标注信息。段的主要功能是区分碎片区中的页与其他区组中的区。

段
这两个段就是 B+ 树索引中的叶子、非叶子结点。也可以说,非叶子结点段与叶子结点段构成了整个 ibd 文件。

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