linux：R的安装和jupyter连接

前提：jupyter已经安装好

• 安装R

1. 使用yum的方式安装：yum install  epel-release；sudo yum install R

报错：【Error 256】No more mirrors to try

解决：依次执行以下语句：yum clean all；yum makecache，yum -y update；yum install  epel-release；sudo yum install R

成功：

• 安装Rstudio：在R控制端进行
• 法一：使用以下语句安装：install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))

报错：

解决：找到文件Rprofile文件并添加镜像设置：find / -name Rprofile；进入到该路径的文件下添加：vi Rprfile

#set a CRAN mirror
    local({r <- getOption("repos")  
           r["CRAN"] <- "https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/"  
           options(repos=r)}) 

修改完文件运行：install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))

报错：

部分包会安装失败，直接用命令重新安装一遍即可，如果还不行，用法二试试

• 法二：

sudo apt-get install gfortran
sudo apt-get install build-essential 
sudo apt-get install libxt-dev 
sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev
sudo apt-get install libxml++2.6-dev
sudo apt-get install libssl-dev
sudo R  # 进入R

install.packages("devtools", dependencies = T)
library(devtools)  # 如果没有任何提示就代表成功了

• IRkernel的安装与激活，在R控制台输入以下命令

devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()

不报错，则说明成功，可以看到

• 新建文件进行测试