qq_39206732的博客

原创 ubuntu 使用其他用户（主用户）下的anaconda

前提：系统用户下已经安装好anaconda，其他用户如何使用该配置而不用另外安装anaconda（节省磁盘资源）文件：在该文件底部下面添加 ，保存文件退出。

原创 解决 libstdc++.so.6: version ‘GLIBCXX_3.4.30‘ not found 问题

复制 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 文件 到指定目录（我这里是/home/hdm/.conda/envs/R4.3/lib/libstdc++.so.6）删除原路径的libstdc++.so.6文件：sudo rm /home/hdm/.conda/envs/R4.3/lib/libstdc++.so.6。1、检查 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 该文件是否存在GLIBCXX_3.4.30。

原创 conda环境继承

4、激活环境。

原创 上传项目到github 仓库

如图所示：去自己的github账号上添加ssh key ，设置title ，把id_rsa.pub里面的内容复制到key里面。git remote add origin git项目仓库地址（ssh地址：例如git@...）生成成功后，去对应目录C:\用户\X\ .ssh 里面的 id_rsa.pub。git push -u origin master #将项目推到GitHub。，ls如果有2个文件，则密钥已经生成，id_rsa.pub就是公钥。在自己的项目下打开git，执行下面指令。

原创 conda install package失败 PackagesNotFoundError

然后选择 所要对应平台下载的 name ，例如我是RMG/wget。1、conda install package 失败。2、输入要install的package 查看路径源。

原创 在服务器上配置torch 基于gpu （torch.cuda.is_available()的解决方案）

3、删除自己用户下面的.condarc 文件，没有换源过的忽略（我之前在自己的.condarc上面添加过换源 不知道是不是这个原因导致先前的失败）（注：如果是cpu上的应该失败了，避免用换源的路径下载）（注：我只知道自己的步骤可以运行成功，其他问题不清楚）2、查看cuda running版本 nvcc -V。5、查看pytorch是否装在（gpu）cuda上。4、去官网找到对应版本pytorch（前提：创建好自己的conda虚拟环境。1、查看 驱动nvidia-smi。

原创 服务器磁盘占满，虚拟机启动不起来【解决方案】

4、删除占用比较大的文件（具体看个人选择，但是安装了什么导致磁盘爆了就选择删除它吧emm） rm -rf xxx（文件路径）3、查看当前目录下面的软件占用情况 du -sh *（所要删除的文件有进程正在进行先klii ，命令。killall -9 firefox（进程名））报错没有权限： sudo rm -rf。1、查看磁盘占用情况 df -h。主要解决方案是释放磁盘。

原创 NVIDIA cuda 驱动、cuda running 版本以及torch cuda版本对应关系

版本号向下兼容 nvidia cuda>cuda running>torch cuda。3、查看pythorch cuda版本号。2、查看cuda running版本。1、nvidia cuda驱动版本。

原创 从git克隆项目失败

git克隆失败

转载 NVIDIA驱动失效

NVIDIA、CUDA

原创 博客摘录「 Cell Reports：去除宿主和胞外DNA以提高微生物基因组得率（痰液样本）」生信笔记1

类似的，“宏基因组”就是“基因组之上的基因组”，研究对象是某一样品中的全部基因组。比如研究人类肠道微生物，研究对象就是肠道中全部微生物群体的基因组，甚至包括人体的基因组。3、宏基因组测序：宏基因组测序是微生物鉴定和功能分析的重要手段。然而，宿主DNA的含量过高，微生物基因组得率较低是影响其分析的一大障碍。1、选择性去除宿主DNA可增加宏基因组测序过程中菌群基因的覆盖度。2、去除宿主DNA对检测到的菌群组成的影响（宏基因组测序）

转载 conda 激活虚拟环境报错CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use ‘conda activa

原创 安装miniconda+pycharm环境配置

本人之前在pycharm里配置了python3.10的环境，为了避免冲突，选择了python3.9的。python版本选择跟安装miniconda时一样的。2、在pycharm里面配置miniconda。

原创 从github下载项目（clone）

从github下载/克隆项目