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原创 论文发表的相关网址

小木虫查期刊;letPub网址上可查询SCI具体的分布;会伴有CCF的三类文章提供,比较高水平的。链接:https://www.myhuiban.com/journals发表专利的具体:先找代理 通过代理才发最后的专利

2020-09-29 16:45:16 139

原创 医学图像资源收藏

1、2018到2008,10年CVPR/NIPS/ECCV/ICML顶会精选论文+代码集合资源:https://github.com/zziz/pwc#20182、U-net (2015-2020)论文及代码 https://github.com/ShawnBIT/UNet-family3、香港中文大学窦琪博士主页(深度学习方面医学图像分割论文):http://www.cse.cuhk.edu.hk/~qdou/香港中文大学窦琪博士,深度学习在医学图像分割中的模型泛化性能研究(视频分享–经典):

2020-09-29 16:30:00 394

原创 数据处理走过的坑

处理的三维数据,始终是黑色,LiTS数据131个训练集,30个测试集,如果我将它们转化为二维的切片,有一些数据没有标签,就只保存有标签的数据,但是nii数据转化为Bmp为什么全是黑色,,,以及数据维度这方面的问题,没有真正理解通透。如果我切完继续保存为Nii格式,怎么把它转化为其它方式加入训练中。1、nii数据输入网络的形式2、三维数据与二维数据的具体转化代码3、像素值与分辨率以及尺寸的关系...

2019-10-31 22:58:22 214

原创 memoryerror!!!!

最近加载图像训练,笔记本控制台输出memoryerror!我在想导致这个的原因真的是数据太大,GPU太小溢出吗??1、数据过大,数据重复加载2、电脑打开的程序串口多,关机重启3、换台电脑再试一下程序方法总比困难多。。...

2019-10-14 11:27:26 764

原创 网络数据维度,输入输出参数,读取数据的方式注意!!!

1、图像中专业名字通道、维度、RGB、胡灰度、像素点、像素值、张量2、数据路径+读取数据方式os.getcwd()获取当前文件路径os.path.join(string1,string2)string1路径下的string2文件名下的所有数据加载import matplotlib.image as pltplt.imread()灰度图是二维;彩色图(RGB)是三维的opencv读灰度...

2019-10-14 11:18:25 464

原创 numpy文件存取的函数

一、tofile()和fromfile()tofile()将数组中的数据以二进制格式写进文件tofile()输出大的数据不保存数组形状和元素类型等信息fromfile()函数读回数据时需要用户指定元素类型,并对数组的形状进行适当的修改example:a=np.arange(0,10)a.tofile(“a.bin”)b = np.fromfile(“a.bin”,dtype = np....

2019-08-15 19:35:52 478

原创 #####比较恼火的阶段,记录一下memoryerror

问题描述:一种图片,它的shape是,!这是输出的shape大小在这里插入图片描述,当使用img = io.imread(dir)img = np.array(img)im = Image.fromarray(img),这句会有错误发生,是数据溢出,各种百度找不到解决方法。。。。接着我用裁剪,把它变小,发现数据也无法达到,出现索引越界,爆炸...

2019-08-07 21:14:55 338 2

原创 医学图像比赛记录

知识积累:期刊TMI:IEEE Transactions on Medical Imaging MIA:Medical Image Analysis会议MICCAI:International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention9-10月IPMI:Information Proce...

2019-08-02 10:05:46 336

原创 openslide安装问题

在wndows上安装与在Linux安装遇到的问题不一样,网上博客很多解决方法,但是针对linux的还没解决。一、win上安装没有问题,下载二进制文件安装,再进行openslide安装链接可参考这个https://openslide.org/download/配置适合自己python版本的二、linux上安装的问题,只安装对应的包肯定报错,还需要其它库,但是在环境为离线环境下,安装一些报就不那么...

2019-07-28 15:55:10 1182

原创 相关比赛网址及提交说明

2017年LiTS数据:https://drive.google.com/drive/folders/0B0vscETPGI1-Q1h1WFdEM2FHSUE医学图像分割中需要dice+focal 与 dice+ce进行结果的对比。2019年相关数据的准换xml—json可参考线上的网页转化,这只是针对单个文件的转换,若要进行批量转换则需要进行代码的阅读与编写,下面是我的一个例子:from ...

2019-07-23 17:29:41 415

转载 代码模型相关

神经网络模型中的相关问题转载首先,看见checkpoint陌生又熟悉,这里有清晰的解答,鼠标放在函数名上,ctrl+B,或者ctrl+点击函数名,可以跳转到函数的定义,可以知道tf.train.get_checkpoint_state函数通过目录下的checkpoint文件找到checkpoint状态proto。训练可能分成多次迭代,在迭代期间或者训练完成测试之前,需要将训练得到的参数保存到一...

2019-07-23 17:06:39 254

原创 学习小记

图像分割路线@TOCunet->3dunet>unet++首先是Python基础,参考廖雪峰学习网站https://www.liaoxuefeng.com/wiki/0014316089557264a6b348958f449949df42a6d3a2e542c000,了解基础语法以及掌握,一定要自己动手写代码实现功能。。结合B站上的视频学习,当然编译器可以是Pycharm或者jup...

2019-02-26 11:26:48 196

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