生信
文章平均质量分 55
朝鲜冷面杀手Richard
这个作者很懒,什么都没留下…
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R包安装记录
因为重复安装会引起某些问题以及冲突 已安装: library(pheatmap)热图包原创 2022-01-01 20:43:39 · 164 阅读 · 0 评论 -
R热图练习
作图笔记: 1.getwd先获取工作目录 csvpath <- file.choose() 获取文件路径,run选择文件 csvpath是查看文件路径,对应上面定义的名字 df<- read.csv(csvpath,header=T,row.names = 1) df为任意取名字,指定文件路路径,header是看文件有没有表头,有就是T,没有就F,row.names使用文件第一列当行名 直接df是查看文件内容 dim(df)看文件数据几行几列 head(df)看文件前六列 2.读入基因表达量数.原创 2022-01-01 20:36:23 · 1691 阅读 · 0 评论 -
作图笔记汇总
1.R 高级绘图函数 1.1 基本作图函数plot() R 语言中最基本的绘图函数为 plot(),其一般形式为: plot(x, y, type='p', main="main title", sub="sub title", xlab="x axis label", ylab="y axis label", lty = 1, lwd = 1, cex = 1, asp = NA) 参数x,是 plot() 必须的参数,指定了绘图数据点的坐标,类型必须为数值型; 参数y,同为绘图数据点的坐标,但y为可选原创 2021-12-08 22:48:03 · 221 阅读 · 0 评论 -
生信笔记:脚本编程
所谓编程,就是让计算机为解决某个问题而使用某种程序设计语言编写程序代码,并最终得到相应结果的过程。构成程序代码的基本元素包括常量、变量、表达式等之前讲述的内容,然而现实的问题往往复杂到用表达式是无法解决的。所以程序必然包括能将常变量、表达式等程序设计语言中的基本元素组织起来的方法。本章将带领我们进入 R 作为程序语言学习的第二个层次——控制结构,以及第三个层次——函数与类。 ...原创 2021-12-02 14:19:37 · 208 阅读 · 0 评论 -
生信R语言:对数据的管理
数据基本信息获取 获取数据的基本情况: summary() 函数。 任何 R 对象都可作为summary() 函数的参数,返回对象的统计和概要信息,日常常用且实用的函数。 获取数据维度:dim() 函数 对于高维数据,如矩阵和数据框,dim() 函数可返回对象的维度:行数,列数。 获取数据长度: **length()**函数 用于计算向量、矩阵中元素的个数。 对于一个数据框,length() 则返回列(即变量)的个数。 R 中还有一个计算对象长度的函数:lengths()。注意区分二者: lengths()原创 2021-11-11 15:25:10 · 1209 阅读 · 0 评论 -
生信R语言:总结知识点
矩阵 matrix 二维的数据结构,看作二维的向量也可。 R 中用于生成矩阵的函数是:matrix()函数, 将其它数据结构的数据转换为矩阵:通过 as.matrix() 函数 与向量类似,同一矩阵中无法同时包含不同类型的数据。 matrix0 <- matrix(vector, #matrix() 函数以一个向量为输入数据,并将该向量转换为矩阵类型; nrow=number_of_rows, #参数nrow定义了矩阵的行数 ncol=number_of_co原创 2021-10-28 20:43:01 · 1236 阅读 · 0 评论