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统计分析
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统计分析/PCA,PCoA,NMDS等的区别
相信大家在做微生物多样性研究时经常听到PCA分析、PCoA分析,NMDS分析,CCA分析,RDA分析。它们对物种(或基因、功能)的分析具有重要作用,因而频频出现在16S测序及宏基因组测序中。那么你知道这些分析之前到底有什么区别吗?在什么情况下应该用什么分析呢?今天小编就给大家讲讲其中的奥秘。首先,以上分析本质上都属于排序分析(Ordination analysis)。排序(ordination)的...转载 2018-04-02 10:51:27 · 27267 阅读 · 1 评论 -
使用R计算方差和标准差
第一个例子:> x <- c(2.5,0.5,2.2,1.9,3.1,2.3,2,1,1.5,1.1)> y <- c(2.4,0.7,2.9,2.2,3.0,2.7,1.6,1.1,1.6,0.9)> cov(x,y)[1] 0.6154444> var(x,y)[1] 0.6154444> Z <- cbind(x,y)> Z...原创 2019-04-08 19:54:01 · 36346 阅读 · 0 评论