LeetCode187 重复的DNA序列 Java

  • 题目:

    所有 DNA 都由一系列缩写为 'A','C','G' 和 'T' 的核苷酸组成,例如:"ACGAATTCCG"。在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。
    
    编写一个函数来找出所有目标子串,目标子串的长度为 10,且在 DNA 字符串 s 中出现次数超过一次。
    
  • 示例 1:

    输入:s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"
    输出:["AAAAACCCCC","CCCCCAAAAA"]
    
  • 示例 2:

    输入:s = "AAAAAAAAAAAAA"
    输出:["AAAAAAAAAA"]
    
  • 提示

    • 0 <= s.length <= 105
    • s[i]'A''C''G''T'
思路 :
  1. 方案一:滑动窗口。(s.substring实现是new一个String,频繁创建对象需耗费较多的内存)
  2. 方案二:位运算+滑动窗口。总共就四个字母,两个字节就可以存下,并且总长度为10故int类型就可以存下是个字符。为了避免频繁创建对象,将10个字符转为int类型。当这个int值出现两次时再创建对象。(猜测会比方法一更省空间和时间)
示例一:
class Solution {
    public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) {
        if (s.length() < 10) {
            return Collections.emptyList();
        }
        Set<String> resultSet = new HashSet<>();
        Set<String> set = new HashSet<>();
        char[] chars = s.toCharArray();
        for (int i = 0; i <= chars.length - 10; i++) {
            String str = s.substring(i, i+10);
            if (set.contains(str)) {
                resultSet.add(str);
            } else {
                set.add(str);
            }
        }
        return new ArrayList<>(resultSet);
    }
}
结果:
  • 执行了17 ms,击败64%的用户

在这里插入图片描述

示例二:
class Solution {
	static Map<Character, Integer> map = null;
    static {
        map = new HashMap<Character, Integer>() {{
            put('A', 0);
            put('C', 1);
            put('G', 2);
            put('T', 3);
        }};
    }

    public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) {
        int l = 10;
        int strLen = s.length();
        if (strLen <= l) {
            return Collections.emptyList();
        }

        // 统计每个字符串出现的次数
        Map<Integer, Integer> countMap = new HashMap<>();
        List<String> result = new ArrayList<>();
        int b = 0;
        // 将前十个字符转为字节,每个字符占两个字节
        for (int i = 0; i < l; i++) {
            b = (b << 2) | map.get(s.charAt(i));
        }
        countMap.put(b, 1);
        int a = ((1 << (l * 2)) - 1);
        for (int i = 1; i <= strLen - l; i++) {
            // 在后面追加一个字符
            b = (b << 2) | map.get(s.charAt(i + l - 1));
            // 去掉第一个字符
            b = b & a;
            int c = countMap.getOrDefault(b, 0) + 1;
            countMap.put(b, c);
            if (c == 2) {
                result.add(s.substring(i, i + l));
            }
        }
        return result;

    }
}
结果:

怎么就更慢了呢,我不李姐,求大佬指教

在这里插入图片描述

  • 0
    点赞
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值