CTD数据处理

本文介绍了海鸟公司CTD产品的数据处理流程,包括数据转换、校正、滤波、编辑和计算等多个步骤,并提到了SBE Data Processing软件的使用。在处理结束后,通过ASCII out导出ASC文件,便于进一步分析。文中还提及了一个简单的Python程序用于读取ASC文件。
摘要由CSDN通过智能技术生成

CTD数据处理

  • 最近处理了一些海鸟公司的CTD产品,数据处理软件使用SBE Data Processing软件下载地址,软件的文档也可以在上述界面下载
  • 处理CTD时候主要流程如下,应根据自己的实际需要进行处理,可参考
  • Data conversion数据转换,将原始数据HEX文件,转换为CNV文件
  • Align CTD,由于CTD数据的响应时间不同,所以对temperature和conductivity进行修订,参数设置均为0.050
  • Cell thermal mass 对电导率计算进行修正,设置参数为alpha=0.03,1/beta=7.0
  • Filter low pass filter A/B :0.03、0.15,对pressure进行滤波
  • Loop edit对船只上下起伏进行处理,minimum velocity 0,remove surface soak 不选,exclude scans marked bad 点选
  • Derive根据压力、温度、电导率和经纬度等信息,计算盐度、密度、声速等要素
  • Bin average进行平均
  • ASCII out 导出成asc文件格式

下面介绍一些操作注意事项,与最后代码

  • 首先是CTD原始数据,每个站点分别包含hex、xmlcon、bl、hdr、mrk共5哥同名文件,打开SBEDataProcessing软件,选择data conversion,在instrument configuration file选择xmlcon文件,如果要处理一个航次的多个文件,注意勾选下面的match instrument configuration to input file。在data setup-select output variables中,根据自己的实际应用,选择自己需要的变量
  • 剩余操作可以参考上面提到的这里
  • 最后一步操作选择ASCII out,注意data setup-label columns选择top of the file,column separator选择comma,这样我们就可以方便的对最后结果进行操作。输出的结果包含一个hdr文件和一个同名的asc文件,hdr文件记录了文件的头文件,asc则类似于csv文件,记录了我们需要的各项参数。下面是一个简单的程序读取asc文件
import pandas as pd
def loadASC(path):
	f 
对于使用Matlab读取CTD数据,可以使用一些相关的工具和函数来实现。其中,可以考虑使用以下几种方法: 1. 使用Matlab的文本文件读取函数,如`textscan`或`importdata`,来读取CTD数据文件。这些函数可以根据文件的格式和结构,将数据读取到Matlab的变量中进行后续处理和分析。 2. 如果CTD数据文件是以特定的格式存储的,可以使用Matlab中的相关工具箱或函数来读取该格式的文件。例如,如果CTD数据文件是以NetCDF格式存储的,可以使用Matlab中的NetCDF工具箱来读取和处理该文件。 3. 如果CTD数据文件是以其他特定格式存储的,可以尝试查找和使用第三方的Matlab工具箱或函数来读取该格式的文件。例如,可以搜索和使用与CTD数据格式兼容的Matlab工具箱或函数。 需要注意的是,具体的读取方法和工具箱可能会根据CTD数据文件的格式和结构而有所不同。因此,在实际操作中,需要根据具体的CTD数据文件格式和要求,选择合适的方法和工具来读取数据。 \[1\] 提供了一个Matlab程序GOdist,用于分析Affymetrix芯片表达数据,与CTD数据读取无关。 \[2\] 提供了一个Perl程序GOArray,用于确定相关的GO术语对于GOI是否过表达,与CTD数据读取无关。 \[3\] 提供了一个工具L2L,用于发现芯片数据中隐藏的生物学显著性,与CTD数据读取无关。 #### 引用[.reference_title] - *1* *2* *3* [GO分析相关工具汇总](https://blog.csdn.net/SHMILYRINGPULL/article/details/8168839)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] [ .reference_list ]
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