python中利用mne获取.mat文件中的脑电数据,画出epochs数据图像。

本文介绍如何使用Python的mne库读取.mat格式的脑电数据,构造epochs对象并进行ICA去伪迹处理。通过示例代码展示了在添加通道类型后可能出现的问题,并给出了成功创建epochs对象的解决方案。
摘要由CSDN通过智能技术生成

这是我写的第一篇文章,主要是怕这段程序会在我想要的时候会找不到了,同时也给想用mne处理.mat类型的脑电数据的人提供一些借鉴的方法。其实我也是刚把程序运行成功。对这段程序(_ = ori_custom_epochs[‘right_hand’].average().plot(time_unit=‘s’)
plt.show())不太懂。
如有什么问题,请多指教,哈哈。
因为想用mne库中ICA方法对脑电数据进行去除伪迹,.GDF和.EDF类型的脑电数据采用mne中的ICA方法在网上容易找到类似的代码,不过没找到对.mat数据类型处理的代码。
我也利用mne从.mat中获得原始数据构造raw,然后使用ICA方法处理,不过,总是在添加了eeg类型时(如:raw.set_channel_types({‘EEG-AF3’:‘eeg’},为通道EEG-AF3添加类型为eeg),输出的脑电图就会不对。

下面这张图就是没添加eeg类型时,输出的脑电图,正常。
的述

但是要利用mne库的滤波和ICA方法都是要为每个通道添加类型(如:eeg,eog)下面这张图就是为每个通道添加了类型后的脑电图,很明显是错的。
加入了标签

后面我就看到可以构造epochs类型的脑电图,

如果你已经使用MNE库对脑电数据进行了预处理,并且想要将结果导出到MATLAB格式的文件,你可以使用MNE的`mne.io.export_data`函数。以下是将MNE库预处理完的脑电mat数据集导出到MATLAB格式的简单步骤: 1. 导入需要的库和数据集 首先,你需要导入MNE库以及其他必要的库(如numpy和scipy),并且加载你要处理的数据集。可以使用MNE的`mne.io.read_raw_xxx`函数来加载不同格式的脑电数据集,如EDF、BDF或FIF格式。例如,如果你的数据集是EDF格式,你可以使用以下代码: ``` import mne raw = mne.io.read_raw_edf('your_data.edf') ``` 2. 预处理数据集 在对数据进行分析之前,通常需要对数据进行预处理。这包括去除噪声、滤波、标准化和修剪。在MNE,你可以使用各种函数来执行这些预处理步骤。例如,你可以使用以下代码来滤波数据: ``` raw.filter(1, 40) # 从1到40Hz进行带通滤波 ``` 3. 导出数据 一旦你对数据进行了预处理,你可以使用`mne.io.export_data`函数将数据导出到MATLAB格式的文件。以下是导出数据的示例代码: ``` from mne.externals import scipy scipy.io.savemat('your_data.mat', mdict={'raw': raw.get_data()}) ``` 在上面的示例代码,使用`scipy.io.savemat`函数将数据导出到MATLAB格式的文件。`mdict`参数用于指定要导出的变量名和值。在这个例子,我们将整个数据集保存为名为`raw`的变量。 这就是将MNE库预处理完的脑电mat数据集导出到MATLAB格式的简单步骤。请注意,你可能还需要导出事件和通道信息,具体取决于你的分析需求。
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