Java------最长公共子序列

  1. package test;
    
    public class test3 {
    
    	public static void main(String[] args) {
    		// TODO Auto-generated method stub
    		String []x=new String[]{"","A","C","T","C","C","T","A","G"};//比较序列X
    		String []y=new String[]{"","C","A","T","T","C","A","G","C"};//比较序列Y
    		int [][]b=new int [x.length][y.length];//数组b是用来存储c[i][j]是由哪个子问题的解得到的
    		int m,n;
    		m=x.length-1;
    		n=y.length-1;
    		
    		lcsLength(x,y,b);
    		lcs(m,n,x,b);
    
    	}
    	public static int lcsLength(String []x,String[]y,int[][]b){
    		int m=x.length-1;
    		int n=y.length-1;
    		int [][]c=new int[m+1][n+1];//数组c存储最长公共子序列的长度
    		for(int i=1;i<=m;i++)
    			c[i][0]=0;
    		for(int i=1;i<=n;i++)
    			c[0][i]=0;
    		for(int i=1;i<=m;i++)
    			for(int j=1;j<=n;j++){
    				if(x[i]==y[j]){
    					c[i][j]=c[i-1][j-1]+1;//如果元素相等,就让最长公共子序列长度在上一个最长的长度基础上+1
    					b[i][j]=1;//规定为1时,表示Xi和Yj的最长公共子序列是由Xi-1和Yj-1的
    					//最长公共子序列加上当前元素(即指向左上角)
    				}
    				else if(c[i-1][j]>c[i][j-1]){
    					c[i][j]=c[i-1][j];
    					b[i][j]=2;//规定为2时,表示Xi和Yj的最长公共子序列是由Xi-1和Yj的
    					//最长公共子序列相同(即指向左边)
    				}
    				else{
    					c[i][j]=c[i][j-1];
    					b[i][j]=3;//规定为3时,表示Xi和Yj的最长公共子序列是由Xi和Y的
    					//最长公共子序列相同(即指向左边)
    				}
    			}
    		return c[m][n];
    		
    	}
    public static void lcs(int i,int j,String []x,int [][]b){
    	if(i==0||j==0) return ;
    	if(b[i][j]==1){
    		lcs(i-1,j-1,x,b);
    		System.out.print(x[i]);
    	}
    	else if(b[i][j]==2)
    		lcs(i-1,j,x,b);
    	else
    		lcs(i,j-1,x,b);
    }
    }
    

如 上图(这个图是从其他地方找来的,不是我自己弄的),当b[i][j]=1时,往左上角(即最长公共子序列由左上角+1得到),其他类推

公共子序列不是集合,它与集合不同,它与原来序列的顺序有关,谁在前谁在后

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