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行者的博客

不思,固有惑;不求,固无得;不问,固不知!

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转载 echo 命令用法

echo命令: 用于字符串的输出1.显示普通字符串:echo "It is a test"这里的双引号完全可以省略,以下命令与上面实例效果一致:echo It is a test2.显示转义字符:echo "\"It is a test\""结果将是:"It is a test"同样,双引号也可以省略3.显示变量:read 命令从标准输入中读取一行,并...

2019-01-11 20:06:02 4917

原创 vim 基础

vim 具有两种操作模式:1.  普通模式;2. 插入模式;打开需要编辑的文件时(或新建一个文件),vim编辑器会进入普通模式。在普通模式中vim会将按键解释成命令。在插入模式中,vim会将你在当前光标位置输入的每一个键都插入到缓冲区,按下i键即可进入插入模式,Esc键退出插入模式。在普通模式中,可用方向键在文本区域移动光标,或按键操作;h: 左移一个字符;j: 下移...

2019-01-10 21:44:07 176

转载 cufflinks 介绍&使用

一. 简介Cufflinks下主要包含cufflinks,cuffmerge,cuffcompare和cuffdiff等几支主要的程序。主要用于基因表达量的计算和差异表达基因的寻找。Cufflinks程序主要根据Tophat的比对结果,依托或不依托于参考基因组的GTF注释文件,计算出(各个gene的)isoform的FPKM值,并给出trascripts.gtf注释结果(组装出转录组)。...

2019-01-09 21:35:19 22103

转载 grep命令

grep 命令简介  grep (global search regular expression(RE) and print out the line,全面搜索正则表达式并把行打印出来)是一种强大的文本搜索工具,它能使用正则表达式搜索文本,并把匹配的行打印出来。  Unix的grep家族包括grep、egrep和fgrep。egrep和fgrep的命令只跟grep有很小不同。egre...

2019-01-09 20:41:40 33298 1

空空如也

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