生物信息
melody359
这个作者很懒,什么都没留下…
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使用annovar注释突变数据
1.annovar下载安装https://doc-openbio.readthedocs.io/projects/annovar/en/latest/annovar官方网站的的下载需要使用邮箱注册后才可下载,这里为了使用方便我将刚下载的annovar上传到了网盘链接:https://pan.baidu.com/s/1T0PhTP1TMADsoFApTUPUOw提取码:uw7f...原创 2020-09-15 17:50:13 · 2479 阅读 · 3 评论 -
使用awk将gencode gtf注释文件转换为bed格式
gencode注释文件下载1.gencode注释文件下载地址:https://www.gencodegenes.org/human/release_35lift37.html安装gawk安装gawk主要是为了调用gensub功能,有关gensub功能解释见:http://blog.sina.com.cn/s/blog_6e5e78bf0100waml.htmlsudo apt-get install gawk格式转换#首先看一下gtf文件,我们所需要的是基因的位置注释性息,也就是第三列为ge原创 2020-09-07 15:19:54 · 2688 阅读 · 0 评论