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原创 Ubuntu解决非root权限安装并使用openmpi

非root权限安装openmpi

2023-02-23 19:17:55 452

原创 django使用mysql记录

django配置mysql数据库在settings.py里面修改:DATABASES = { 'default': { 'ENGINE': 'django.db.backends.mysql', 'NAME': 'clinical_data',#数据库的名字 '...

2023-02-21 15:17:19 103

原创 Amber进行分子动力学模拟以及计算mmpbsa

使用amber进行分子动力学模拟,并且使用mmpbsa模块进行氨基酸残基自由能分解

2023-02-21 15:12:36 1901 2

原创 根据共晶结构找配体中心以及配体盒子(pymol)

根据蛋白质配体结构找配体盒子

2022-07-08 19:44:19 1372

原创 根据小分子药物的名字找作用的靶点蛋白

1.在chembl上输入小分子药物的名称,在展开的结果中找到相应的结构点开:点进入后选择 drug mechanisms,就可以看到潜在的靶点:点击进入靶点,其中Preferred Name和Synonyms均可以作为查询靶点的关键词:2.在PDB数据库中寻找蛋白质结构,用上述关键词,找出包含该蛋白(复合物、与其他蛋白相互作用结构等)的任意一个即可。但是如果有亚型,要下载全部亚型验证。...

2021-10-29 23:55:23 2083

原创 13.半监督学习

13.1 未标记样本(1)主动学习(2)聚类假设 、流行假设(3)纯半监督学习、直推学习13.2 生成式方法13.3半监督SVM

2021-10-08 10:50:21 163

原创 pytorch

1.torch.rand(*size,out)表示随机生成在[0,1)均匀分布的数字,返回一个张量2.torch.randn(*size,out)表示随机生成均值为0,方差为1的正态分布分布的数字,返回一个张量

2021-10-08 09:57:58 48

原创 django项目部署服务器,依赖admin界面的样式丢失

公司的django项目依赖于自带的admin,但是在服务器部署的时候出现界面css样式的丢失1.首先要提取出django中admin的自带static文件:在terminal中,执行语句:python manage.py collectstatic2.在IIS管理器中添加static映射:打开IIS管理器,找到添加映射的网站,右键->添加虚拟目录3.在static文件中添加配置:https://blog.csdn.net/q1925387431/article/details/89921

2021-08-15 20:13:16 497

原创 windows server2016服务器中使用iis部署django网站

买的全新的服务器,装了Windows server2016的系统,已经用django框架写完了代码,希望用IIS部署1.在服务器中新建IIShttps://www.cnblogs.com/yanglang/p/11056924.html2.安装wfastcgi,从下面文章的第3开始看https://www.cnblogs.com/djangocn/p/10227006.html3.具体的部署过程,读至第10步以前(不包含第10步)https://blog.csdn.net/wxl3105/art

2021-08-15 20:05:19 335

原创 django中mysql的配置以及关系映射

1.django配置mysql数据库:在settings.py里面修改:DATABASES = { 'default': { 'ENGINE': 'django.db.backends.mysql', 'NAME': 'clinical_data',#数据库的名字 'USER': 'root', 'PASSWORD':'521sulli', 'HOST':'127.0.0.1', 'PORT':33

2021-08-09 16:23:23 153

原创 小程序与java后端交互

1.在servlet文件夹下,新建一个新的java类,命名为miniservlet重写doGet()、doPost()方法:public class miniServlet extends HttpServlet { @Override protected void doGet(HttpServletRequest req, HttpServletResponse resp) throws ServletException, IOException { resp.set

2021-04-25 09:49:20 162 1

原创 pyvip包的问题

cannot load library 'libvips-42.dll'"ModuleNotFoundError: No module named '_libvips'"但是我已经安装了pyvips,是init.py文件中import _libvips这一行报错。解决方法:路径的错误在pyvips__init__.py文件中import _libvips之前,加入:your_path指在vips-dev文件在电脑中的路径import osos.environ['PATH'] =.

2021-04-19 17:10:05 2218 7

原创 创建django项目的命令

1.打开cmd,并且将路由转换至想创建文件夹的位置2.输入django-admin startproject data_analysis 标注黄色的位置为自己起的文件名3.打开pycharm项目,在控制台输入:python manage.py startapp analysis 黄色位置也为自己起的名字4.在settings.py里面的installedapp里面写下当前项目的名字(最后一行)...

2021-04-19 16:44:55 164

gold_dock.py

使用gold文件,修改代码中的protein和ligand就可以通过ccdc的python-api实现分子对接。并且在控制台中输出每个参考配体出用新分子的得分(大->小)。

2021-10-31

空空如也

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