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热力图和PCA降维图
## 标题热力图和PCA降维图@TOC数据介绍部分:这次作图是基于医院胃的WSI图切成的patch,我们保存的格式是h5的格式,这部门数组会用来生成热力图;PCA图调用的是测试生成的slide_id.npy文件(由tok-50的归一化数组构成)。[slide数据是这样,每张wsi的topk-50(postive)和topk-50(negtive),分别对应着数组数据和patch_id.接下来给出部分heatmap和PCA代码。import numpy as npimport matplotli原创 2020-12-02 16:19:26 · 1100 阅读 · 0 评论 -
SWT平稳随机小波变换
pywt小波变换(空间域转频域)@SWT平稳随机小波变换将图片读入调用小波函数库处理图片(注意要改一下底层图片的输入尺寸)数组向量的标准化保存图片(格式自行定义)def transform_SWT(): arr = cv2.imread(path) arr = cv2.resize(arr, (512, 512)) arr = cv2.cvtColor(arr, cv2.COLOR_BGR2GRAY) image = pywt.swt2(arr, 'bior1.3', level=1,原创 2020-09-07 16:51:18 · 3290 阅读 · 0 评论