各种聚类分析的原理与示例

1. K-Means聚类

原理：

K-Means聚类通过迭代优化使得每个数据点到其最近质心的距离之和最小。该算法假设簇是球形的，并且每个簇的大小大致相等。

推导：

1. 初始化K个质心，可以随机选择K个数据点作为初始质心。
2. 将每个数据点分配到距离最近的质心，形成K个簇。
3. 更新每个簇的质心为簇内所有数据点的平均值。
4. 重复步骤2和3，直到质心位置不再变化或达到最大迭代次数。

数学表示：

。

优点：

1. 简单易理解：K-Means算法简单，易于实现和理解。
2. 高效：K-Means算法的时间复杂度为O(nki)，其中n是样本数量，k是聚类数，i是迭代次数。通常情况下，算法收敛速度较快。
3. 适用广泛：适用于大多数数值型数据的聚类任务，特别是球形聚类效果较好。

缺点：

1. 需要预设K值：需要提前指定聚类数K值，这在实际应用中可能不容易确定。
2. 对初始值敏感：对初始质心的选择敏感，不同的初始质心可能导致不同的聚类结果。
3. 只适用于线性分离：假设数据是线性可分的，无法处理复杂的非线性结构。
4. 对噪声和离群点敏感：对噪声和离群点比较敏感，这些点可能会显著影响聚类结果。

算法步骤

1. 初始化：随机选择K个初始质心。
2. 分配数据点：将每个数据点分配到最近的质心，形成K个簇。
3. 更新质心：计算每个簇的质心，即所有簇内数据点的平均值。
4. 迭代：重复步骤2和3，直到质心不再发生变化或达到最大迭代次数。

示例

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.datasets import make_blobs

# 生成示例数据
centers = [[2, 2], [8, 8], [5, 5]]
X, _ = make_blobs(n_samples=300, centers=centers, cluster_std=0.7, random_state=42)

# 数据标准化处理
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)

# 使用K-Means算法进行聚类（假设K=3）
k = 3
kmeans = KMeans(n_clusters=k, random_state=123)
kmeans.fit(X_scaled)

# 获取聚类标签
labels = kmeans.labels_

# 可视化聚类结果
plt.scatter(X_scaled[:, 0], X_scaled[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.scatter(kmeans.cluster_centers_[:, 0], kmeans.cluster_centers_[:, 1], s=300, c='red', marker='X')
plt.title(f'K-Means Clustering (k={k})')
plt.xlabel('Feature 1')
plt.ylabel('Feature 2')
plt.show()

2. 均值漂移聚类 (Mean Shift Clustering)

原理：

均值漂移聚类是一种基于密度的聚类方法，通过迭代移动质心到数据点密度最高的区域，最终质心收敛到密度峰值。

推导：

1. 初始化每个数据点为一个质心。
2. 对每个质心，计算其邻域内所有数据点的密度梯度，移动质心到密度最大的方向。
3. 重复步骤2，直到质心位置不再变化或移动距离小于设定阈值。
4. 合并距离较近的质心，形成最终的簇。

数学表示：

优点：

1. 不需要预设簇数：均值漂移聚类不需要像K-Means那样提前指定簇的数量。
2. 适用于任意形状的簇：可以处理非球形簇，适用于任意形状的簇。
3. 处理噪声：可以很好地处理噪声和离群点，因为它聚焦于高密度区域。

缺点：

1. 计算量大：均值漂移聚类的计算量较大，尤其是对大规模数据集，计算速度较慢。
2. 带宽选择困难：算法效果对带宽参数非常敏感，选择合适的带宽较为困难。
3. 边界模糊：簇与簇之间的边界可能不清晰。

算法步骤：

1. 初始化：将每个点初始化为一个质心。
2. 计算密度梯度：在每个质心周围计算密度梯度。
3. 更新质心位置：将质心移动到密度梯度最大的位置。
4. 合并质心：当质心不再发生变化或质心移动距离小于设定阈值时，停止移动。将距离较近的质心合并为一个簇。

示例

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.cluster import MeanShift, estimate_bandwidth
from sklearn.datasets import make_blobs

# 生成示例数据
centers = [[2, 2], [8, 8], [5, 5]]
X, _ = make_blobs(n_samples=300, centers=centers, cluster_std=0.7, random_state=42)

# 数据标准化处理
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)

# 使用均值漂移算法进行聚类
bandwidth = estimate_bandwidth(X_scaled, quantile=0.2, n_samples=200)
meanshift = MeanShift(bandwidth=bandwidth, bin_seeding=True)
meanshift.fit(X_scaled)

# 获取聚类标签和质心
labels = meanshift.labels_
cluster_centers = meanshift.cluster_centers_

# 可视化聚类结果
plt.scatter(X_scaled[:, 0], X_scaled[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.scatter(cluster_centers[:, 0], cluster_centers[:, 1], s=300, c='red', marker='X')
plt.title('Mean Shift Clustering')
plt.xlabel('Feature 1')
plt.ylabel('Feature 2')
plt.show()

3. 基于密度的聚类方法 (DBSCAN)

原理： DBSCAN通过寻找密度高的区域进行聚类。它定义了核心点、边界点和噪声点，并根据这些定义形成簇。

推导：

1. 标记核心点：对于数据集中每个点，计算其eps邻域内的点数，如果邻域内点的数量不小于min_samples，则标记为核心点。
2. 形成簇：将核心点及其eps邻域内的所有点组成一个簇，并将这些点标记为已访问。
3. 扩展簇：继续检查簇中的每个点，扩展其邻域内的所有核心点，直到没有新的点可以加入。
4. 标记边界点和噪声点：剩余未访问的点如果在某个核心点的eps邻域内，则标记为边界点，否则标记为噪声点。

优点：

1. 不需要预设簇数：DBSCAN不需要像K-Means那样预设簇的数量。
2. 能够发现任意形状的簇：能够识别任意形状的簇，而不仅仅是球形簇。
3. 处理噪声和离群点：可以很好地处理噪声和离群点，不受离群点的影响。

缺点：

1. 参数选择困难：需要指定两个参数eps（邻域半径）和min_samples（最小样本数），参数选择不当会影响聚类效果。
2. 高维数据处理困难：在高维数据中，DBSCAN效果可能不如其他聚类算法。

算法步骤：

1. 标记核心点：对于数据集中每个点，计算其eps邻域内的点数，如果邻域内点的数量不小于min_samples，则标记为核心点。
2. 形成簇：将核心点及其eps邻域内的所有点组成一个簇，并将这些点标记为已访问。
3. 扩展簇：继续检查簇中的每个点，扩展其邻域内的所有核心点，直到没有新的点可以加入。
4. 标记边界点和噪声点：剩余未访问的点如果在某个核心点的eps邻域内，则标记为边界点，否则标记为噪声点。

示例

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.cluster import DBSCAN
from sklearn.datasets import make_blobs

# 生成示例数据
centers = [[2, 2], [8, 8], [5, 5]]
X, _ = make_blobs(n_samples=300, centers=centers, cluster_std=0.7, random_state=42)

# 数据标准化处理
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)

# 使用DBSCAN算法进行聚类
dbscan = DBSCAN(eps=0.3, min_samples=5)
dbscan.fit(X_scaled)

# 获取聚类标签
labels = dbscan.labels_

# 可视化聚类结果
plt.scatter(X_scaled[:, 0], X_scaled[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.title('DBSCAN Clustering')
plt.xlabel('Feature 1')
plt.ylabel('Feature 2')
plt.show()

# 打印聚类结果信息
n_clusters_ = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0)
n_noise_ = list(labels).count(-1)
print(f'Estimated number of clusters: {n_clusters_}')
print(f'Estimated number of noise points: {n_noise_}')

4. 高斯混合模型 (GMM)

原理： GMM是一种基于概率模型的聚类方法，它假设数据由多个高斯分布的混合模型生成。通过最大期望（EM）算法来估计模型参数。

推导：

1. 初始化：选择初始参数，包括均值、协方差矩阵和混合系数。
2. E步（期望步）：计算每个数据点属于每个簇的后验概率。

3.M步（最大化步）：更新参数，使得给定后验概率时，数据的对数似然最大化。

1. 迭代：重复E步和M步，直到对数似然函数收敛或达到最大迭代次数。

优点：

1. 适用于任意形状的簇：GMM可以生成椭圆形的簇，因此比K-Means更灵活，能够更好地拟合非球形簇。
2. 软聚类：GMM提供了每个点属于每个簇的概率，可以进行软聚类，而不仅仅是硬聚类。
3. 统计基础：GMM基于概率模型，提供了丰富的统计信息，如每个簇的均值、协方差等。

缺点：

1. 参数估计复杂：需要估计多个参数（均值、协方差矩阵、混合系数），计算量大。
2. 对初始值敏感：对初始参数值较敏感，可能导致局部最优解。
3. 需要预设簇数：与K-Means类似，GMM也需要预设簇数K。

算法步骤：

1. 初始化：选择初始参数，包括均值、协方差矩阵和混合系数。
2. E步（期望步）：计算每个数据点属于每个簇的后验概率。
3. M步（最大化步）：更新参数，使得给定后验概率时，数据的对数似然最大化。
4. 迭代：重复E步和M步，直到对数似然函数收敛或达到最大迭代次数。

示例

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.mixture import GaussianMixture
from sklearn.datasets import make_blobs

# 生成示例数据
centers = [[2, 2], [8, 8], [5, 5]]
X, _ = make_blobs(n_samples=300, centers=centers, cluster_std=0.7, random_state=42)

# 数据标准化处理
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)

# 使用高斯混合模型进行聚类（假设K=3）
k = 3
gmm = GaussianMixture(n_components=k, random_state=123)
gmm.fit(X_scaled)

# 获取聚类标签
labels = gmm.predict(X_scaled)

# 获取每个数据点的簇概率
probabilities = gmm.predict_proba(X_scaled)

# 可视化聚类结果
plt.scatter(X_scaled[:, 0], X_scaled[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.scatter(gmm.means_[:, 0], gmm.means_[:, 1], s=300, c='red', marker='X')
plt.title('GMM Clustering')
plt.xlabel('Feature 1')
plt.ylabel('Feature 2')
plt.show()

# 打印聚类结果信息
print(f'Estimated number of clusters: {k}')

5. 凝聚层次聚类

原理： 凝聚层次聚类是一种自底向上的聚类方法，它通过迭代合并最相似的簇来生成层次结构（树状图）。

推导：

1. 初始化：将每个数据点看作一个单独的簇。
2. 计算距离：计算所有簇之间的距离（可以使用各种距离度量，如欧氏距离、曼哈顿距离等）。
3. 合并最近的簇：找到最近的两个簇并将它们合并为一个簇。
4. 更新距离矩阵：更新距离矩阵，计算新簇与其他所有簇之间的距离。
5. 重复：重复步骤3和4，直到所有簇合并为一个簇或达到预定的簇数。

距离计算方法：

优点：

1. 不需要预设簇数：与K-Means不同，凝聚层次聚类不需要预先设定簇的数量。
2. 生成层次结构：可以生成一个树状结构（树状图），方便观察不同层次的聚类结构。
3. 适用于任意形状的簇：可以识别任意形状的簇，适用性强。

缺点：

1. 计算复杂度高：凝聚层次聚类的计算复杂度较高，尤其是对于大规模数据集，计算速度较慢。
2. 对噪声和离群点敏感：对噪声和离群点比较敏感，这些点可能会影响聚类结果。
3. 无法撤销合并：一旦两个簇合并，就无法撤销，这可能导致次优的聚类结果。

算法步骤：

1. 初始化：将每个数据点看作一个单独的簇。
2. 计算距离：计算所有簇之间的距离（可以使用各种距离度量，如欧氏距离、曼哈顿距离等）。
3. 合并最近的簇：找到最近的两个簇并将它们合并为一个簇。
4. 更新距离矩阵：更新距离矩阵，计算新簇与其他所有簇之间的距离。
5. 重复：重复步骤3和4，直到所有簇合并为一个簇或达到预定的簇数。

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage

# 生成示例数据
from sklearn.datasets import make_blobs
centers = [[2, 2], [8, 8], [5, 5]]
X, _ = make_blobs(n_samples=300, centers=centers, cluster_std=0.7, random_state=42)

# 数据标准化处理
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)

# 使用凝聚层次聚类（假设K=3）
k = 3
agg_cluster = AgglomerativeClustering(n_clusters=k, metric='euclidean', linkage='ward')
agg_cluster.fit(X_scaled)

# 获取聚类标签
labels = agg_cluster.labels_

# 可视化聚类结果
plt.scatter(X_scaled[:, 0], X_scaled[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.title('Agglomerative Clustering')
plt.xlabel('Feature 1')
plt.ylabel('Feature 2')
plt.show()

# 绘制树状图
linked = linkage(X_scaled, method='ward')
dendrogram(linked)
plt.title('Dendrogram')
plt.xlabel('Samples')
plt.ylabel('Distance')
plt.show()

# 打印聚类结果信息
n_clusters_ = len(set(labels))
print(f'Estimated number of clusters: {n_clusters_}')