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RSS订阅原创 文献精读1---拟南芥二倍体和四倍体之间染色体互作与组蛋白修饰和转录调控的影响
原文 " The effects of Arabidopsis genome duplication on the chromatin organization and transcriptional regulation " doi: 10.1093/nar/gkz511 文章概述：使用HiC技术比较二倍体与同源四倍体之间染色体在空间上的互作差异，再结合RNA-seq和Chip-seq分析基因组加倍、染色质互作、组蛋白修饰、基因转录水平之间的关系 三维基因组简介 三维基因组的层次结构研究中：染色体在核内不
2022-05-22 18:46:52
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原创 用R画出染色体修饰图谱--超详细版本
用R画出染色体修饰图谱—染色体之间的物理长度之比不变 准备数据 1.染色体长度信息文件 全基因组文件建立index时可获取 2.将染色体以1Mb 滑动划分区间 bedtools makewindows -g genome.txt -w 1000000 > genome_windows_1Mb.bed 计算深度 1.准备mapping之后的bam文件 2.按照染色体位置进行排序 samtools sort wheat.bam > wheat.sorted.bam 3.排序后的bam文件建立In
2020-07-20 12:07:59
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空空如也
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