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Almond_02
这个作者很懒,什么都没留下…
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【CP2K教程(三)】元动力学 (Metadynamics)与增强采样
cp2k元动力学和chatGPT。元动力学是一种用于分子模拟的计算方法,通过添加偏置电势来增强自由能景观的采样。它的开发是为了克服构象转变缓慢的问题,并改进复杂系统中罕见事件的探索。Metadynamics于2002年由Michele Parrinello和Alessandro Laio首次引入。它建立在伞形采样和自适应偏置力等先前方法的基础上,并基于用高斯丘陵填充自由能盆地的想法,以鼓励系统探索配置空间的新区域。原创 2023-02-15 10:49:52 · 5614 阅读 · 0 评论 -
【CP2K教程(二)】石墨烯和 h-BN 的投影态密度
因为程序仅在 Γ 处采样, 除非另有说明,否则我们将难以获得有意义的态密度采样(例如,布里渊区上的网格将太粗糙)。另一种选择(我们将在下一个练习中研究)是对 k 点进行采样。通常,您现在会使用高斯绘制卷积图以获得平滑的 DOS,但您也可以简单地将其绘制为散点图或垂直线图。两者都具有相同的二维晶体结构,唯一的区别是晶格常数,一个仅由碳组成,另一个由硼和氮组成。另请注意能量的单位,单位为 Eh。在查看 DOS 图时,您可能希望将其转换为 Electronvolt。原创 2022-09-08 20:22:49 · 1497 阅读 · 0 评论 -
【CP2K教程(二)】WO3的投影态密度和能带结构
1. WO3的投影态密度和能带结构2. 获得WO3晶格的能带结构。原创 2022-09-08 13:25:35 · 2824 阅读 · 0 评论 -
【CP2K教程(一)】元动力学(metadynamics)与增强采样技术
对于本教程,给出了一些输入和输出文件,以提供解决给定问题的完整过程。还给出了一些提示以帮助分析结果。为了能够运行这些示例,需要在输入文件中正确设置一些路径(即设置变量 LIBPATH、XYZPATH、RUNPATH)。坐标总是从 xyz 文件中读取。这些练习所需的所有坐标文件都收集在 XYZ 中,而 LIB_TOOLS 包含 PP、基组和 DFTB 参数文件。原创 2022-08-22 20:50:11 · 8539 阅读 · 0 评论