安装netcdf和netcdf-fortran后,成功安装模型
但是运行模型时报错:
error while loading shared libraries: libifport.so.5: cannot open shared object file: no such file or directory
检查文件夹$NETCDF/lib/,包括以下内容:
libnetcdf.a libnetcdff.a libnetcdff.la libnetcdff.so libnetcdff.so.6 libnetcdff.so.6.1.1 libnetcdf.la libnetcdf.settings libnetcdf.so libnetcdf.so.11 libnetcdf.so.11.0.0 pkgconfig
缺少libifport.so.5
比较疑惑的是,之前安装同一版本的netcdf和netcdf-fortran后,该文件夹下有libifport.so.5,但是超算平台系统更新openmpi版本后,重新安装netcdf后,没有出现libifport.so.5。
虽然原因未知,但还是要检索能解决报错的方法,参考如下链接:
https://www.myroms.org/forum/viewtopic.php?t=3081
简单来说,这个链接提到的解决方法如下:
1. go to the directory where your intel compuler(s) are installed
小白怎么找自己的intel安装目录?
我用的超算平台采用module load 的方式设置环境变量,因此这一步中,我进入的是平台可选择load的apps的目录
2. 输入
find . -name libifport.so.5 -print
可能得到的结果
.../lib/intel64/libifport.so.5
3. 不用管上一步输出的lib下的其他文件夹,只将输出结果中的..../lib/intel64 加入到 LD_LIBRARY_PATH. 即
export LD_LIBRARY_PATH= .../lib/intel64:$LD_LIBRARY_PATH
模型成功运行!