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原创 【记录向】经验分享:Pyscenic软件不兼容报错解决方法
2024/2/19 转录因子分析软件Pyscenic常用于分析单个细胞群受到的转录因子调控,目前版本为0.12.1,在使用Pyscenic 进行分析的时候报错:AttributeError: module 'numpy' has no attribute 'object'.为numpy软件不兼容所致。综合GITHUB上的解决方案,依旧存在问题。按照上述软件安装即可。
2024-02-19 21:24:34 456 1
原创 【python】实现寻找多个数组/列表的交集/并集/差集
最近搞了个小项目,想要寻找相同的信号通路,我有几个信号通路的列表,想要求它们的交集,然后,去网上寻找求多个数组交集的办法,结果却都是这样的:a = 【1,2,3】b = 【2,3,4】c = 【3,4,5】r = list(set(a).intersection(b,c))print(r)就需要在intersection函数后面输入所有的数组名称,这也太僵硬了,我有50个数组的话岂不是要输到天荒地老?下面进入正文,通过csv文件读取,整合到嵌套列表中,统计了很多信号通路,读取
2022-03-30 11:13:16 3120
原创 【自用学习】R语言如何获取指定字符串前面的字符串
在进行特定表格的行名,列名或者指定行列的文本处理时,我们一般使用str_split函数进行操作,如对R语言的列名进行操作:library(stringr)#以列名为样本,以.x为分割符,取前面的部分names(file_total) <- str_split(names(file_total),"\\.x",simplify = T)[,1]但是如果我们以多个字符串为样本时(而非表格中的数据),再用上面相同的代码会报错,比如在提取文件的文件名过程中,我们如果使用同样的代码:lib
2022-03-14 12:38:53 6064
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