03:基因相关性

03:基因相关性

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描述

为了获知基因序列在功能和结构上的相似性,经常需要将几条不同序列的DNA进行比对,以判断该比对的DNA是否具有相关性。

现比对两条长度相同的DNA序列。首先定义两条DNA序列相同位置的碱基为一个碱基对,如果一个碱基对中的两个碱基相同的话,则称为相同碱基对。接着计算相同碱基对占总碱基对数量的比例,如果该比例大于等于给定阈值时则判定该两条DNA序列是相关的,否则不相关。

输入

有三行,第一行是用来判定出两条DNA序列是否相关的阈值,随后2行是两条DNA序列(长度不大于500)。

输出

若两条DNA序列相关,则输出“yes”,否则输出“no”。

样例输入

0.85
ATCGCCGTAAGTAACGGTTTTAAATAGGCC
ATCGCCGGAAGTAACGGTCTTAAATAGGCC

样例输出

yes

碱基对概念
碱基对是形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说,碱基对是一对相互匹配的碱基(即A:T,G:C,A:U相互作用)被氢键连接起来。然而,它常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。它还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和一个碱基组成。

import java.io.BufferedReader;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStreamReader;

public class Main {

	public static void main(String[] args) {
		BufferedReader bf = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in));
		double n = 0;
		String x;
		String y;
		try {
			n = Double.parseDouble(bf.readLine().toString());
			x = bf.readLine().toString();
			y = bf.readLine().toString();
			
			int m = x.length();
		
			double ans = m;
			double sum = 0;
			
			//每个碱基对以一比对,统计个数
			for (int i = 0; i < m ; i++) {
				if((x.substring(i, i+1)).equals(y.substring(i, i+1))) {
					sum++;
				}
			}
			//判断是否有序
			if(sum/ans>=n){
				System.out.println("yes");
			}else {
				System.out.println("no");
			}
		} catch (IOException e) {
			e.printStackTrace();
		}
	}
}
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