Linux下基于MPI的hello程序设计

Linux下基于MPI的hello程序设计

一、MPICH并行计算库安装

在Linux环境下安装MPICH执行环境，配置MPD.CONF, 完成临近机器间的并行配置。

（一）创建SSH信任连接，实现免秘钥互相连接

步骤自行拟定，截图和描述

1. 

3个虚拟机都做一遍

2.更改主机名

3．生成密钥和公钥

3个虚拟机都做一遍

4．3个虚拟机互相上传公钥

5．确认信任连接

结果验证：

确认四台机器的信任连接已建立

对每个节点执行：

#ssh node01

#ssh node02

#ssh node03

#ssh node04

在提示处输入yes回车，最后确定无需输入密码并且没有任何提示信息即可登陆（"Last login:时间日期"提示信息除外）

（二）安装MPICH 3.4

https://www.mpich.org/static/downloads/3.4/mpich-3.4.tar.gz

（1）安装Mpich 

1. 解压缩文件包
2. 

1. 创建安装目录

1. 进入mpich解压目录

4、设置安装目录

#./configure --prefix=/usr/MPICH-install

5、编译

#make

如果编译不成功的提醒内容是什么？解释并截图

编译成功的截图

6、安装

#make install

7、退出到root目录

#cd ..

8、通过编辑.bashrc文件修改环境变量

#vi .bashrc

修改后的.bashrc文件如下：

# .bashrc

# User specific aliases and functions

alias rm='rm -i'

alias cp='cp -i'

alias mv='mv -i'

PATH="$PATH:/usr/MPICH-install/bin"   新增加的

#Source global definitions

if [ -f /etc/bashrc ]; then

   ./etc/bashrc

Fi

9、测试环境变量设置

#source ~/.bashrc

#which mpicc

#which mpiexec

#which mpirun

10、修改/etc/mpd.conf文件，内容为secretword=myword

#vi /etc/mpd.conf

设置文件读取权限和修改时间

#touch /etc/mpd.conf

#chmod 600 /etc/mpd.conf

11、创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts

#vi mpd.hosts

文件内容如下：

node01

node02

node03

node04

sudo vi mpd.hosts

（三）配置NFS

为了方便 MPICH 的安装及并行程序的运行,最好将 MPICH的安装目录及用户家目录通过 NFS 网络文件系统共享。对于仅包含几个结点的较小的集群系统,可以任意指定其中一个结点作为 NFS服务器。对较大的集群系统,应设定一个或数个结点专门用于文件服务,这些结点称为 I/O 结点,它们专门负责存储设备的管理,不参加计算。这里选择 node01 作为 NFS 服务器,将它的 /home 和/usr/MPICH-nstall目录输出给其他三个结点,相应的配置步骤如下。

1、 以 root 身分登录到 node01 上，确保 node1 上安装了NFS 程序 (nfs-utils 包)。首先运行命令来开启 NFS 服务:

此处分别设置nfs和nfslock随系统启动。

然后重启nfs和nfslock进程

1. 切换到root身份

sudo su

（2）安装rpm

（3）查看当前节点是否有nfs服务

（4）安装nfs服务

（5）检查nfs服务的状态

（6）设置nfs服务开机启动和设置nfs和nfsslock随系统启动

然后编辑文件 /etc/exports,在其中加入下面二行 (如果该文件不存在则创建一个新文件):

  /home      (node01的ip)/24(rw,async,no_root_squash)

  /usr/MPICH-install (node01的ip)/24(rw,async,no_root_squash)

1. 编辑文件

sudo nano /etc/exports

(2)查看共享目录

做好上述修改后执行命令，让上述内容生效:

  填写什么命令？

便完成了 /home 和 /usr/local 目录的输出。

2、 以root 身份登录到其余三个结点,在文件 /etc/fstab中加入下面两行:

  node01:/home       /home        nfs defaults 0 0

  node01: /usr/MPICH-install /usr/MPICH-install nfs defaults 0 0

并且运行挂载命令:

填写相应命令

如果不成功，可能需要安装nfstools相关软件包。

1. 以root身份登录其他3个节点

sudo su

/home/node01

（2）编辑文件sudo nano /etc/fstab

（3）安装nfstools工具

（4）进行远程文件挂载

完成上面的步骤后,node02,node03和node04 应该共享node01的/home和 /usr/MPICH-install 目录。可以在任何一个结点上用 df 命令来验证,例如:

  # df

返回类似下面所示的结果：

  ... ...

  node01:/home             248632644 224028484 11974280 95% /home

  node01:/usr/MPICH-install        246966888 200888560 33533076 86% /usr/local

（四）环境测试

本地测试

测试运行MPICH的例子程序

查询如何编译mpi源代码，如何运行mpi程序

1. nano hello,c
2. Mpicc -o hello hello.c
3. Mpirun -np 4 ./hello