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原创 样本相关性分析说明了什么问题

样品间的相关性反应了样品间的相似程度，即不同处理或组织的样品在表达水平方面的相似度。相关系数越接近1，样品间的相似度越高，样品间的差异基因也越少。生物学重复间的样品的相关系数应大于生物学重复外的样品的相关系数。生物学重复的相关性不仅可以检验生物学实验操作的可重复性；还可以评估差异表达基因的可靠性和辅助异常样品的筛查。样品相关性是利用基因的FPKM值计算相关系数的计算方法有三种：A. Pearson correlation; B. Spearman rank correlation; C. Kendall