trimmomatic报错“home/user/class/02_clean_reads/TruSeq3-PE.fa (No such file or directory)”的解决

文章讲述了在处理生物信息学数据时遇到的错误,即找不到TruSeq3-PE.fa文件。作者指导如何定位文件至正确的~/miniconda3/pkgs/trimmomatic-0.39-hdfd78af_2/share/trimmomatic-0.39-2/adapters路径,并通过cd和ls命令逐步查找,最后将文件复制到home/user/class/02_clean_reads目录以解决问题。

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这个错误的意思是找不见TruSeq3-PE.fa 文件,所以只要我们把它找见并且放到对应的文件夹内就可以了。根据报错信息,找见TruSeq3-PE.fa 文件之后应该把它放在home/user/class/02_clean_reads路径下。

TruSeq3-PE.fa所在路径::~/miniconda3/pkgs/trimmomatic-0.39-hdfd78af_2/share/trimmomatic-0.39-2/adapters

由于我们使用的trimmomatic版本应该是不一样的,所以需要通过cd和ls命令一步一步寻找到adapters文件夹。

像这样:

一步一步找下去,最终就可以找到adapters文件夹下的TruSeq3-PE.fa,然后把它复制到目标文件夹就好啦 ~

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