lefse分析

LEfSe(LDA Effect Size)分析,可以用于两个或多个分组之间的比较,从而找到组间 有显著性差异的物种(即 biomarker),分析步骤主要分为三步:

Step1:利用 Kruskal-Wallis 秩和检验检测所有的特征物种,通过检测不同组间的物种丰 度差异,获得显著性差异物种。

Step2:再利用 Wilcoxon 秩和检验检测上步获得的显著性差异物种的所有亚种是否都趋 同于同一分类级别。

Step3:最后用线性判别分析(LDA),得到最终的差异物种(即 biomarker)。

 

  • 1
    点赞
  • 13
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值