将csv文件导入gephi，并构建图（带地理信息）

将csv文件导入gephi，并构建图（带地理信息）

思路：

有时候，构建了网络后，无法保存为gexf文件，保存了可能无法使用gephi打开。有一种处理的方法，是将nodes和edges数据导入到gephi中。但是自己的数据导入到gephi中，往往会有一些问题。这边推荐：先在gephi中根据自己的数据创建列，如lon、lat列，并将列的类型设为Float 。之后，将空的gephi 节点、边数据导出，将自己的数据填充到对应的列。再将文件导入gephi中，就没有什么问题了。

eg：给node.csv文件添加lon、lat用于地理布局

1. gephi_nodes.csv导出

1. 在gephi 数据资料视图中，添加lon、lat两列。导出为csv空文件：gephi_nodes.csv
2. 导出：注意列的选择，不需要的列要去掉

2. gephi_edges.csv导出

gephi边文件导出：

注意：gephi导出的边文件选项中，默认包含 Source,Target两列 。 注意去掉不需要的列

3. 自己的数据填充到gephi_nodes和gephi_edges中

3.1自己的nodes、edges数据展示：

edges数据中的起终节点列分别是node_start和node_end,下面使用python代码进行处理，填充到gephi_edges中

​

3.2 数据处理（python）

import pandas as pd
gephi_edges = pd.read_csv('./test/gephi_edges.csv')
gephi_nodes = pd.read_csv('./test/gephi_nodes.csv')

# nodes 数据处理：
gephi_nodes['Id'] = nodes['nodeID']\
# 将nodes的geometry，分成lon|lat两列
O_xy = nodes['geometry'].apply(lambda p: list(p.coords)).explode().apply(pd.Series).rename(columns=({0:"x", 1:"y"}))
nodes['x'] = O_xy['x']
nodes['y'] = O_xy['y']
gephi_nodes['lon'] =nodes['x'] 
gephi_nodes['lat'] = nodes['y'] 
gephi_nodes.to_csv('./test/gephi_nodes_output.csv',index=False)  #！！！保存为csv文件时，一定要去掉索引

# edges数据处理
gephi_edges['Source'] = edges['node_start']
gephi_edges['Target']= edges['node_end']
gephi_edges['Weight'] = edges['weight']
gephi_edges.to_csv('./test/gephi_edges_output.csv',index=False)  #！！！保存为csv文件时，一定要去掉索引

注意：一定不要保存默认的索引

4. csv文件导入到gephi中

4.1 节点数据导入

4.2 边数据导入

5. 最终效果

5.1 python 中networkx绘制的 网络：

5.2 gephi展示（使用 Geo Layout）