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原创 关于R包部分不能直接install.packages()安装的问题,或提示版本有问题的解决方案①
在R官方镜像网站下载对应工具包到本地直接安装(如常报错的ggplot2和rlang包4.10等可有效解决)https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/在左侧栏选择packages选项选中需要安装的包点击 Package source链接下载tar.gz文件在Rgui界面本地安装即可部分生信包可在BiocManager中安装...
2021-03-03 16:02:43 1769 1
原创 Error: protect(): protection stack overflow [防护堆叠上溢] 解决方案①
在执行R代码是遇到防护堆叠上溢的error,有效方案①1、命令行到Rgui.exe的地址(cmd)2、输入Rgui.exe --max-ppsize=5000003、在打开的R中输入options("expressions"=20000)memory.limit(size=8000000)https://www.researchgate.net/post/error_protect_protection_stack_overflow_in_R...
2021-03-03 15:52:52 6883 4
原创 R 3.6.1 BiocManager 包
安装了R3.6.1以后 以前的很多程序包都无法使用了,如rbsurv,Biobase等,常规的install.packages和biocLite方法都不能正常使用。R版本更新以后,对于Bioconductor包,现在CRAN上安装一个叫BiocManager的包后用它来安装。#install.packages("BiocManager")BiocManager::install("***"...
2019-07-11 10:14:24 13893
原创 R升级(使用installr包)
R升级使用installr包,可直接升级R或者全部包。#install.packages("installr")library("installr")updateR(cran_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/") #链接无法打开时括号内有内容###library包后菜单栏有installr选项,可直接选择升级内容...
2019-07-10 11:04:42 5252
原创 R---XGBoost
R笔记xgboost模型19.03.21error in list()…某元素为空[最后多加了一个逗号]bst <- xgboost.train()模型数值提取class(bst)xgb.Boosterraw: 1.4 Kbcall:xgb.train(params = param, data = dtrain, nrounds = nround, watc...
2019-03-21 10:26:52 261
空空如也
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