单细胞教程分析
文章平均质量分 90
songyi10
这个作者很懒,什么都没留下…
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NBIS单细胞教程:细胞类型(六)
此文章是通过学习瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS) 所开放的单细胞分析教程加上网上所查找的资料,自身的理解所形成的,可能会有不足之处。该部分是对不同集群的细胞类型进行识别。参考来源:https://github.com/NBISweden/workshop-scRNAseq/blob/master/labs/seurat/seurat_06_celltype.Rmd感兴趣的话可以阅读原文。原创 2022-11-30 15:21:29 · 957 阅读 · 1 评论 -
NBIS单细胞教程:差异基因(五)
此文章是通过学习瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS) 所开放的单细胞分析教程加上网上所查找的资料,自身的理解所形成的,可能会有不足之处。该部分是对不同集群之间的差异基因进行分析。参考来源:https://github.com/NBISweden/workshop-scRNAseq/blob/master/labs/seurat/seurat_05_dge.Rmd感兴趣的话可以阅读原文。原创 2022-11-30 15:15:40 · 5402 阅读 · 1 评论 -
NBIS单细胞教程:降维聚类(四)
此文章是通过学习瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS) 所开放的单细胞分析教程加上网上所查找的资料,自身的理解所形成的,可能会有不足之处。该部分是使用整合后的PCA来进行聚类。参考来源:https://nbisweden.github.io/workshop-scRNAseq/labs/compiled/seurat/seurat_01_qc.html感兴趣的话可以阅读原文。......原创 2022-08-26 09:04:31 · 1668 阅读 · 3 评论 -
NBIS单细胞教程:批次效应矫正(三)
此文章是通过学习瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS) 所开放的单细胞分析教程加上网上所查找的资料,自身的理解所形成的,可能会有不足之处。该部分是整合不同批次的单细胞数据并矫正批次效应。参考来源:https://nbisweden.github.io/workshop-scRNAseq/labs/compiled/seurat/seurat_01_qc.html感兴趣的话可以阅读原文。原创 2022-08-25 08:25:11 · 1438 阅读 · 0 评论 -
NBIS单细胞教程:降维(二)
参考来源:https://nbisweden.github.io/workshop-scRNAseq/labs/compiled/seurat/seurat_01_qc.html感兴趣的话可以阅读原文。原创 2022-08-24 08:52:23 · 1046 阅读 · 0 评论 -
NBIS单细胞教程:质控(一)
此文章是通过学习瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS) 所开放的单细胞分析教程加上网上所查找的资料,自身的理解所形成的,可能会有不足之处。该部分是对下机处理完成后的数据进行Seurat分析的质控。参考来源:https://nbisweden.github.io/workshop-scRNAseq/labs/compiled/seurat/seurat_01_qc.html感兴趣的话可以阅读原文。原创 2022-08-21 19:30:19 · 5126 阅读 · 0 评论