High Performance Computing
strongwangjiawei
一直在写程序、学IT技术的路上发现着自己,完善着自己,享受着自己。
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A Problem in the BioHDF bioh5g_import_reads tool
Recently, I am modifying the bioinformatics alignment software BWA 's I/O module by HDF5, so firstly I have to convert the fasta/fastq files to .h5 files. I chosed BioHDF BioHDF bioh5g_import to原创 2012-09-18 14:53:37 · 1048 阅读 · 0 评论 -
Google后Hadoop时代的新“三驾马车”——Caffeine、Pregel、Dremel
Google后Hadoop时代的新“三驾马车”——Caffeine、Pregel、Dremel 发表于2012-08-21 09:29| 12341次阅读| 来源wired.com| 12 条评论| 作者CADE METZEMAIL Pregel Dremel Caffeine MapReduce Hadoop 摘要:Google在2003年到2004年公布了关于GFS、Map转载 2012-10-27 21:52:34 · 2294 阅读 · 0 评论 -
Pregel-Inspired Frameworks implementation
今天上网找了许久,找到了基于pregel的几种implementation,现列举在此,省去检索之力! A quick overview of 6 Pregel-inspired frameworks(Apache Hama, GoldenOrb, Apache Giraph, Phoebus, Signal/Collect, and HipG) So, to s原创 2012-10-28 21:11:11 · 980 阅读 · 0 评论 -
Pregel: A System for Large-Scale Graph Processing(译)
Pregel: A System for Large-Scale Graph Processing(译) 2012-09-16 22:12:06| 分类:搜索与分布式 | 标签:pregel google论文 图计算 作者:Grzegorz Malewicz, Matthew H. Austern .etc.Google Inc 2010-6 原文:http原创 2012-10-28 10:11:44 · 9670 阅读 · 1 评论 -
关于搭建Hadoop过程中出现的几个错误
最近因工作需要要打个Hadoop集群,过程中碰到一些问题,也费了些精力去解决,现将这些问题记录一下。 1. root与CDH3u4 CDH默认是不支持root用户的, 如果仍想用 root 来搭建,可以从Apache Hadoop里下载你要的版本来搭建,但是仍会出现 Could not create the J原创 2012-11-20 11:26:41 · 905 阅读 · 0 评论