最长公共子串和最长公共子序列

1. 问题描述

子串为连续的几个字母如lo，至于什么是子序列，这里给出一个例子：有两个母串

• cnblogs
• belong

比如序列bo, bg, lg在母串cnblogs与belong中都出现过并且出现顺序与母串保持一致，我们将其称为公共子序列。最长公共子序列（Longest Common Subsequence,LCS），顾名思义，是指在所有的子序列中最长的那一个。子串是要求更严格的一种子序列，要求在母串中连续地出现。在上述例子的中，最长公共子序列为blog（cnblogs,belong），最长公共子串为lo（cnblogs, belong）。

2. 最长公共子序列

对于母串X=<x1,x2,⋯,xm>, Y=<y1,y2,⋯,yn>，求最长公共子序列。

假设Z=<z1,z2,⋯,zk>是X与Y的LCS， 我们观察到
如果Xm=Yn，则Zk=Xm=Yn，有Zk−1是Xm−1与Yn−1的LCS；
如果Xm≠Yn，则Zk是Xm与Yn−1的LCS，或者是Xm−1与Yn的LCS。
因此，求解LCS的问题则变成递归求解的两个子问题。但是，上述的递归求解的办法中，重复的子问题多，效率低下。改进的办法——用空间换时间，用数组保存中间状态，方便后面的计算。这就是动态规划（DP)的核心思想了。
DP求解LCS
用二维数组c[i][j]记录串x1x2⋯xi与y1y2⋯yj的LCS长度，则可得到状态转移方程

代码如下

import java.util.Scanner;

/**
 * Created by 亮大王 on 2017/10/25.
 * 最长公共子序列
 */
public class LCS {
    public static void main(String[] args) {
        Scanner sc= new Scanner(System.in);
        String str1 = sc.next();
        String str2 = sc.next();
        int n = str1.length();
        int m = str2.length();
        int [][]a = new int [n+1][m+1];
        String [][]b=new String [n+1][m+1];
        LCS_length(str1,str2,a,b);
        LCS_print(b,str1.length(),str2.length(),str1);
    }
    public static void LCS_length(String str1,String str2, int[][]a,String b[][]){
        for(int i = 0;i<=str2.length();i++){
            a[0][i]=0;
        }
        for(int i=0;i<=str1.length();i++){
            a[i][0]=0;
        }
        for(int i=1;i<=str1.length();i++)
            for(int j = 1;j<=str2.length();j++){
                 if(str1.charAt(i-1)==str2.charAt(j-1)){
                     a[i][j]=a[i-1][j-1]+1;
                     b[i][j]="left_up";
                 }
                 else if (a[i-1][j]>a[i][j-1]){
                     a[i][j] = a[i-1][j];
                     b[i][j] = "up";
                 }
                 else {
                     a[i][j] = a[i][j-1];
                     b[i][j] = "left";
                 }
            }
        System.out.println("最长公共字串的长度为"+a[str1.length()][str2.length()]);
    }
    public static void LCS_print(String b[][],int n ,int m, String str1){
        if(n==0||m==0)
           return;
        if("left_up".equals(b[n][m]))
        {
            LCS_print(b,n-1,m-1,str1);
            System.out.print(str1.charAt(n-1));
        }else if("up".equals(b[n][m])){
            LCS_print(b,n-1,m,str1);
        }else {
            LCS_print(b,n,m-1,str1);
        }
    }
}

2. 最长公共子串

代码如下：

import java.util.Scanner;

/**
 * Created by sunwl1993 on 2017/10/25.
 */
public class 最长公共子串 {
    public static void main(String[] args) {
        Scanner sc= new Scanner(System.in);
        String str1 = sc.next();
        String str2 = sc.next();
        int n = str1.length();
        int m = str2.length();
        int [][]a = new int [n+1][m+1];
        LCS(str1,str2,a);
    }
    public static void LCS(String str1,String str2,int a[][]) {
        int max = 0;//记录最长子串的长度
        int temp = 0;//记录最长子串的最后一位在str1中的位置
        for(int i=0;i<=str1.length();i++)
            a[i][0]=0;
        for(int j=0;j<=str2.length();j++)
            a[0][j]=0;
        for(int i=1;i<=str1.length();i++)
            for(int j=1;j<=str2.length();j++){
            if(str1.charAt(i-1)==str2.charAt(j-1)){
                a[i][j]=a[i-1][j-1]+1;
                if(a[i][j]>max){
                    max = a[i][j];
                    temp = i-1;
                }
            }
            else
                a[i][j]=0;
            }
        System.out.println("最长公共子串的长度是"+max);
        for(int i=max-1;i>=0;i--){
            System.out.print(str1.charAt(temp-i));
        }
    }
}