R语言分析蛋白质组学数据：飞行时间质谱(MALDI-TOF)法、峰值检测、多光谱比较...

于 2022-11-07 16:16:55 发布
阅读量749 收藏 2
点赞数
文章标签： r语言 开发语言
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/tecdat/article/details/129393588
版权
该博客详细介绍了使用R语言进行蛋白质组学分析，特别是通过基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF)法处理数据，包括频谱示例、峰值检测、基线校正和多光谱比较等步骤，旨在研究蛋白质表达和生物标志物鉴定。
摘要由CSDN通过智能技术生成

全文链接：http://tecdat.cn/?p=30051

•研究生物体产生的全部蛋白质。

• Foci：鉴定、结构测定、生物标志物、通路、表达（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。

蛋白质组学

•研究生物体产生的全部蛋白质。

• Foci：鉴定、结构测定、生物标志物、通路、表达。

基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF)法示例频谱

b271c4be5df0db9068c25a6fd676163d.png

研究动机

只有相对较少的开源软件解决方案可用，而R平台则很少。

• 处理技术和生物复制的必要性。

• 相对强度的定量令人不满意

• 研究光谱校准对临床预后的影响。

• 模块化且易于定制的分析程序

af426973eaecdcb606540978b370476c.png

点击标题查阅往期内容

a783c298d60e91a39d2d0c8b309cdd22.jpeg

贝叶斯分位数回归、lasso和自适应lasso贝叶斯分位数回归分析免疫球蛋白、前列腺癌数据

outside_default.png

左右滑动查看更多

outside_default.png

01

eab625b88d3304fdcfd310346e0302a2.png

02

d70586a0b18c004d203d745aa42744a3.png

03

1a1eaf25b849d452410a489b8f54f1f4.png

04

03f5c16a576dbbc5e567bcfcde951b42.png

示例数据

血清肽多姆分析显示血小板因子 4 是与胰腺癌相关的潜在鉴别肽

G.M. Fiedler， A.B. Leichtle

最低0.47元/天 解锁文章
拓端研究室TRL
关注
博客
【专题】新能源发电行业及其市场化进程概览白皮书报告合集PDF分享（附原数据表）...
09-27 540
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37802随着中国经济结构的持续优化以及能源政策的不断进步，我国的能源消费呈现出稳定增长的态势（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。与此同时，能源利用效率逐步提高，清洁能源在能源结构中的比例也在稳步上升，这为国家的可持续发展战略提供了有力的支撑。文末204份电力行业研究报告最新趋势已分享在交流群，阅读原文进群和500+行业人士共同交...
博客
【专题】2024重塑正当时：人工智能AI引领银行业变革启航报告合集PDF分享（附原数据表）...
09-26 371
原文链接： https://tecdat.cn/?p=37794人工智能时代已然到来，正全方位重塑着银行业经营的大环境以及社会的各个领域。在汽车行业，特斯拉等企业凭借人工智能技术推出高级驾驶辅助功能，为自动驾驶奠定基础（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。生命科学领域，人工智能应用于药物研发，提升数据处理和工作流程自动化效率，助力研发到上市的全生命周期。公共安全方面，伦敦警察厅试点实...
博客
【专题】2024中国企业数字化转型指数-重塑生产力，增长新前沿报告合集PDF分享（附原数据表）...
09-25 330
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37781全球变局加剧，领先企业优势凸显。企业面临转型挑战，数字化转型从追求创新转向全面重塑。地缘政治、疫情、通胀和气候变化等因素影响全球经济，IMF数据显示2023年增长率降至3.2%（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。在此背景下，生成式AI激发技术变革潜力，全球IT支出预计2024年增至5.26万亿美元。埃森哲全球颠覆指数显示...
博客
R语言非参数回归预测摩托车事故、收入数据：局部回归、核回归、LOESS可视化...
09-25 978
全文链接：https://tecdat.cn/?p=37784非参数回归为经典（参数）回归方法提供了一种灵活的替代方法。与假定回归关系具有依赖于有限数量的未知参数的已知形式的传统（参数）方法不同，非参数回归模型尝试从数据样本中学习回归关系的形式（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频1.1 动机和目标所有非参数回归模型都涉及在拟合观察到的数据样本（模型拟合）和“平滑”函数估计（模型精简）...
博客
【视频讲解】非参数重采样bootstrap逻辑回归Logistic应用及模型差异Python实现
09-24 1224
全文链接：https://tecdat.cn/?p=37759分析师：Anting Li 本文将深入探讨逻辑回归在心脏病预测中的应用与优化。通过对加州大学欧文分校提供的心脏病数据集进行分析，我们将揭示逻辑回归模型的原理、实现过程以及其在实际应用中的优势和不足。同时，我们还将介绍多种优化方法，如牛顿迭代、随机梯度下降和贝叶斯逻辑回归等，以提高模型的性能和准确性（点击文末“阅读原文”获取完整代码...
博客
【专题】2024年中国白酒行业数字化转型研究报告合集PDF分享（附原数据表）
09-24 146
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37755消费人群趋于年轻化，消费需求迈向健康化，消费场景与渠道走向多元化，这些因素共同驱动企业凭借数据能力来适应市场的变化。从消费市场来看，消费群体、需求、场景及渠道皆展现出与以往不同的新态势，促使白酒企业积极拥抱数字化转型，以数据驱动来响应市场的新变化与新趋势（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。年轻群体成为消费的重要力量，白酒...
博客
【专题】2024AI智慧生活白皮书：AI智能科技重塑居家智能家居AIoH体验报告合集PDF分享（附原数据表）...
09-23 192
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37748AI 已然成为家电家居市场的创新核心动力，可在个性化识别、预测维护等多方面提升产品价值。家享生活行业智能化展现多元场景，清洁智能崛起超厨房智能居第二，全屋智能潜力巨大（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。“套装 / 集成智能” 等品类增长快，智能新客多由老客升级，消费有时序性，厨房和卫浴智能是入门，全屋和清洁智能是升级场景...
博客
【专题】2024年9月直播、短视频行业报告合集汇总PDF分享（附原数据表）
09-20 569
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37744在信息时代的浪潮下，直播短视频行业以其独特的魅力和强大的影响力，迅速成为了大众娱乐、信息传播以及商业营销的重要领域（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。从微短剧的异军突起，到 TikTok 在海外市场的蓬勃发展；从抖音平台上的春日热点话题，到 AI 数字人带来的全新体验，直播短视频行业的每一个角落都充满了机遇与挑战。阅读原...
博客
【专题】2024年9月游戏行业报告合集汇总PDF分享（附原数据表）
09-20 738
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37732在当今数字化高速发展的时代，游戏行业已然成为了文化与科技融合的前沿阵地。中国游戏行业凭借着不断创新的技术、丰富多元的内容以及日益拓展的市场，正以蓬勃之姿在全球舞台上绽放光彩（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。阅读原文，获取专题报告合集全文，解锁文末153份游戏相关行业研究报告。2024 年，中国游戏行业面临着新的机遇与挑...
博客
Python用TOPSIS熵权法重构粮食系统及期刊指标权重多属性决策MCDM研究|附数据代码...
09-18 1286
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37724在当今世界，粮食系统的稳定性至关重要。尽管现有的全球粮食系统在生产和分配方面表现出较高的效率，但仍存在大量人口遭受饥饿以及诸多粮食安全隐患。与此同时，在学术领域，准确评估情报学期刊的质量和影响力对于学术研究和信息传播意义重大（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。本研究旨在通过TOPSIS熵权法、多属性决策(MCDM)方法对全球粮食系...
博客
【视频讲解】线性时间序列原理及混合ARIMA-LSTM神经网络模型预测股票收盘价研究实例...
09-14 1062
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37702分析师：Dongzhi Zhang近年来人工神经网络被学者们应用十分广泛，预测领域随着神经网络的引入得到了很大的发展（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。本文认为单一神经网络模型对序列所包含的线性信息和非线性信息的挖掘是有限的，因此本文为了进一步的提高对这两类数据的预测效果，将神经网络与传统的时间序列模型ARIMA模型相结合建立混合...
博客
【专题】2024新能源企业“出海”系列之驶向中东、东南亚报告合集PDF分享（附原数据表）...
09-14 269
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37698在“双碳”目标引领下，中国新能源产业近年迅猛发展，新能源企业凭借技术革新、政策支持与市场驱动实现快速增长，在产业链完备、技术领先、生产效能及成本控制等方面优势显著（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。面对国内外环境不确定性增强的常态化态势，中国新能源企业积极开拓海外市场，开启“出海”征程。阅读原文，获取专题报告合集全文，...
博客
【专题】2024大健康产业热点分析报告合集PDF分享（附原数据表）
09-13 454
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37691自《健康中国2030》规划发布以来，“预防优于治疗”的理念逐渐成为共识。这推动了传统以治疗为中心的健康产业向更广泛的大健康产业转型，形成了一个覆盖面更广、增长动力更强的产业体系。得益于国家政策的大力支持、技术的迅猛发展、市场需求的稳步增长以及医疗消费的持续上升，中国大健康产业迎来了众多新的增长机遇（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集P...
博客
【专题】2024跨境出海供应链洞察-更先进供应链报告合集PDF分享（附原数据表）...
09-12 631
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37665当前，全球化商业浪潮促使跨境电商行业飞速发展，产业带与跨境电商接轨、平台半托管模式涌现、社交电商带来红利机会以及海外仓不断扩张，这使得产业带外贸工厂、内贸工厂、传统进出口企业和品牌企业等纷纷加速布局跨境电商，赛道的繁荣也加剧了供给侧的竞争（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。阅读原文，获取专题报告合集全文，解锁文末408份...
博客
深度神经网络DNN、RNN、RCNN及多种机器学习金融交易策略研究|附数据代码
09-12 1816
全文链接：https://tecdat.cn/?p=37668分析师：Aijun Zhang在当今的金融领域，量化交易正凭借其科学性和高效性逐渐成为主流投资方式之一。随着大数据技术的蓬勃发展，量化交易借助先进的数学模型和计算机分析能力，摒弃了人的主观判断，通过挖掘海量历史数据来锁定各种可能带来超额收益的 “高概率” 事件，从而有效降低投资者在市场波动中因情绪影响而做出非理性决策的风险（点击文末“...
博客
【专题】2024年8月数字化、数智化行业报告合集汇总PDF分享（附原数据表）
09-11 1011
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37649在 2024 年的时代浪潮中，数字化的影响力如涟漪般在各个领域层层扩散。企业作为经济的基本单元，其数字化发展进程关乎整体经济格局的走向，无论是人才的实践探索还是中小企业的转型尝试，都在塑造着新的企业运营模式（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。与此同时，行业的数字化转型也在如火如荼地进行，数智医疗和数字化敏捷银行等领域正经...
博客
TensorFlow深度学习框架改进K-means聚类、SOM自组织映射算法及上海招生政策影响分析研究...
09-11 1581
全文链接：https://tecdat.cn/?p=37652分析师：Chen Zhang在教育政策研究领域，准确评估政策对不同区域和学生群体的影响至关重要。2021 年上海市出台的《上海市初中学业水平考试实施办法》对招生政策进行了调整，其中名额分配综合评价模块的变化尤为关键（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频从机器学习和数据分析的角度来看，这为我们提供了一个极具价值的研究场景。在...
博客
【专题】2024年中国折叠屏手机市场与消费趋势研究报告合集PDF分享（附原数据表）...
09-10 203
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37645中国智能手机市场目前仍处于整体增长瓶颈期，增长复苏未达预期，消费者换机预期周期不断延长，使得行业对破局点的探寻更为紧迫。与此同时，中端消费者购机呈现出消费降级与升级的分化态势，不过更多人会选择体验更好、配置更优的产品以延长使用时间（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。IDC 数据表明，2024 年二季度，600 美元以上高...
博客
Python用MarkovRNN马尔可夫递归神经网络建模序列数据t-SNE可视化研究
09-09 1441
原文链接：https://tecdat.cn/?p=37634本文聚焦于利用马尔可夫递归神经网络（MarkovRNN）结合树库展开建模工作。MarkovRNN 通过整合马尔可夫特性与离散随机变量来深入探索递归神经网络中的随机转换机制，旨在高效处理具有复杂潜在信息的高度结构化序列数据（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。在该模型中，每个时间步的离散样本均源自参数化的分类分布，且潜在信息的编码取...
博客
【专题】2024飞行汽车技术全景报告合集PDF分享（附原数据表）
09-09 856
原文链接： https://tecdat.cn/?p=376286月16日，小鹏汇天旅航者X2在北京大兴国际机场临空经济区完成首飞，这也是小鹏汇天的产品在京津冀地区进行的首次飞行。小鹏汇天方面还表示，公司准备量产，并计划今年四季度开启预售小鹏汇天分体式飞行汽车，探索分体式飞行汽车城际通勤（点击文末“阅读原文”获取专题报告合集PDF版本）。阅读原文，获取专题报告合集全文，解锁文末271份飞行汽车相关...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值