两字符序列的最长公共字符子序列

  求两字符序列的最长公共字符子序列 

问题描述：字符序列的子序列是指从给定字符序列中随意地（不一定连续）去掉若干个字符（可能一个也不去掉）后所形成的字符序列。令给定的字符序列X=“x0，x1，…，xm-1”，序列Y=“y0，y1，…，yk-1”是X的子序列，存在X的一个严格递增下标序列<i0，i1，…，ik-1>，使得对所有的j=0，1，…，k-1，有xij=yj。例如，X=“ABCBDAB”，Y=“BCDB”是X的一个子序列。 

考虑最长公共子序列问题如何分解成子问题，设A=“a0，a1，…，am-1”，B=“b0，b1，…，bm-1”，并Z=“z0，z1，…，zk-1”为它们的最长公共子序列。不难证明有以下性质： 

（1） 如果am-1=bn-1，则zk-1=am-1=bn-1，且“z0，z1，…，zk-2”是“a0，a1，…，am-2”和“b0，b1，…，bn-2”的一个最长公共子序列； 

（2） 如果am-1!=bn-1，则若zk-1!=am-1，蕴涵“z0，z1，…，zk-1”是“a0，a1，…，am-2”和“b0，b1，…，bn-1”的一个最长公共子序列； 

（3） 如果am-1!=bn-1，则若zk-1!=bn-1，蕴涵“z0，z1，…，zk-1”是“a0，a1，…，am-1”和“b0，b1，…，bn-2”的一个最长公共子序列。 

这样，在找A和B的公共子序列时，如有am-1=bn-1，则进一步解决一个子问题，找“a0，a1，…，am-2”和“b0，b1，…，bm-2”的一个最长公共子序列；如果am-1!=bn-1，则要解决两个子问题，找出“a0，a1，…，am-2”和“b0，b1，…，bn-1”的一个最长公共子序列和找出“a0，a1，…，am-1”和“b0，b1，…，bn-2”的一个最长公共子序列，再取两者中较长者作为A和B的最长公共子序列。 

求解：

引进一个二维数组c[][]，用c[i][j]记录X[i]与Y[j] 的LCS 的长度，b[i][j]记录c[i][j]是通过哪一个子问题的值求得的，以决定搜索的方向。

我们是自底向上进行递推计算，那么在计算c[i,j]之前，c[i-1][j-1]，c[i-1][j]与c[i][j-1]均已计算出来。此时我们根据X[i] = Y[j]还是X[i] != Y[j]，就可以计算出c[i][j]。

问题的递归式写成： 

回溯输出最长公共子序列过程：

算法分析：

由于每次调用至少向上或向左（或向上向左同时）移动一步，故最多调用(m + n)次就会遇到i = 0或j = 0的情况，此时开始返回。返回时与递归调用时方向相反，步数相同，故算法时间复杂度为Θ(m + n)。

public static int lcsLength(int[] x,int []y, int[][] b)

{

int m=x.length;

int n=y.length;

int[][] c =new int[100][100];

for(int i=0;i<=m;i++)

{

c[i][0]=0;

}

for(int i=0;i<=n;i++)

{

c[0][i]=0;

}

for(int i=1;i<=m;i++)

{

for(int j=1;j<=n;j++)

if(x[i-1]==x[j-1])

{

c[i][j]=c[i-1][j-1]+1;

b[i][j]=1;

}

else if(c[i-1][j]>=c[i][j-1])

{

c[i][j]=c[i-1][j];

b[i][j]=2;

}

else

{

c[i][j]=c[i][j-1];

b[i][j]=3;

}

}

return c[m][n];

}

public static void lcsprint(int i,int j,int[] x,int[][] b)

{

if(i==0||j==0)return;

if(b[i][j]==1){

lcsprint(i-1,j-1,x,b);

System.out.print(x[i-1]+" ");

}

else if(b[i][j]==2)

{

lcsprint(i-1,j,x,b);

}

else

lcsprint(i,j-1,x,b);

}