R语言安装以及生成benchmarksql测试报告

使用benchmarksql工具对数据库进行稳定性测试过程中，生成测试报告需要依赖R语言，本文记录R安装部署与benchmarksql生成测试报告。

---

一、R语言安装

R语言安装选择的是R-3.6.3，之前安装R-4.2版本发现存在兼容性问题，导致benchmarksql中OS收集脚本os_collector_linux.py无法收集。

• R安装包下载

https://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/

• 上传至服务器，并解压

tar -xf R-3.6.3.tar.gz

• 编译安装

[root@localhost R]# cd R-3.6.3/
[root@localhost R-3.6.3]# ./configure && make && make install

• 验证

[root@localhost R-3.6.3]# R --version
R version 3.6.3 (2020-02-29) -- "Holding the Windsock"
Copyright (C) 2020 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
[root@localhost R-3.6.3]# R
> capabilities()
       jpeg         png        tiff       tcltk         X11        aqua
       TRUE        TRUE        TRUE       FALSE        TRUE       FALSE
   http/ftp     sockets      libxml        fifo      cledit       iconv
       TRUE        TRUE        TRUE        TRUE        TRUE        TRUE
        NLS     profmem       cairo         ICU long.double     libcurl
       TRUE       FALSE       FALSE       FALSE        TRUE        TRUE

二、异常处理

异常1：configure: error: No Fortran compiler found

解决措施：yum -y install gcc-gfortran

异常2：configure: error: C++ preprocessor "/lib/cpp" fails sanity check

解决措施：yum install gcc-c++

异常3： configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available

解决措施：yum -y install readline readline-devel readline-static

异常4： configure: error: --with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available

解决措施：yum -y install xorg-x11-server-devel libX11-devel libXt-devel

异常5： configure: error: zlib library and headers are required

解决措施：yum -y install bzip2-devel

异常6： configure：error: pcre >= 8.20 library and headers are required

解决措施：
yum install -y pcre pcre-devel

异常7： configure: error: libcurl >= 7.22.0 library and headers are required with support for https

解决措施：
下载：https://curl.haxx.se/download/curl-7.47.1.tar.gz
上传解压：tar -xf curl-7.47.1.tar.gz
编译安装：
cd curl*
./configure
make && make install

异常8： configure: WARNING: neither inconsolata.sty nor zi4.sty found: PDF vignettes and package manuals will not be rendered optimally

解决措施：
下载：http://mirrors.ctan.org/fonts/inconsolata.zip
上传解压：unzip inconsolata.zip
拷贝安装：
[root@localhost R]# cp -Rfp inconsolata/* /usr/share/texmf/
[root@localhost R]# mktexlsr
mktexlsr: Updating /usr/share/texlive/texmf/ls-R…
mktexlsr: Updating /usr/share/texlive/texmf-config/ls-R…
mktexlsr: Updating /usr/share/texlive/texmf-dist/ls-R…
mktexlsr: Updating /usr/share/texlive/texmf-local///ls-R…
mktexlsr: Updating /usr/share/texlive/texmf-var/ls-R…
mktexlsr: Done.
验证：
cd R*
./configure

异常8： capabilities() jpeg png tiff tcltk X11 aqua FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE

解决措施：先解决终端x11为false，卸载R（which R -> rm -rf /usr/local/bin/R）重新编译安装。或者选择MobaXterm终端（setting->X11->X11 remote access->full），进行编译安装。

异常9： gcc -std=gnu99 -I"/home/test/R/R-3.6.3/include" -DNDEBUG -I/usr/local/include -fpic -g -O2 -c conftest.c -o conftest.o conftest.c:1:17: fatal error: jni.h: No such file or directory

解决措施：安装javac： yum -y install java-1.8.0-openjdk-devel.x86_64

三、使用R绘制benchmarksql结果

• benchmarksql配置文件

conn=jdbc:kingbase8://127.0.0.1:52222/test  #数据库端口及database
user=system        #测试用户
warehouses=5       #数据仓数
loadWorkers=5      #灌数加载并发数
terminals=5        #压测并发数
runMins=5          #压测时间
limitTxnsPerMin=0
terminalWarehouseFixed=true
newOrderWeight=45
paymentWeight=43
orderStatusWeight=4
deliveryWeight=4
stockLevelWeight=4
resultDirectory=my_result_%tY-%tm-%td_%tH%tM%tS   #结果收集日志目录
osCollectorScript=./misc/os_collector_linux.py    #结果收集脚本
osCollectorInterval=1                             #数据采集间隔
osCollectorDevices=net_ens33 blk_sda              #采集网口名(ip addr)和磁盘名(lsblk)

• 灌数

$benchmarksql/run/runDatabaseBuild.sh props.pg

• 压测

$benchmarksql/run/runBenchmark.sh props.kb

• 解析结果

chmod +x generateReport.sh
chmod +x generateGraphs.sh
./generateReport.sh my_result_2024-08-09_054647/

• 查看tpmc结果