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R语言
twentyonepilots
这个作者很懒,什么都没留下…
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R语言&Python GEO DataSets多个Series进行差异基因表达分析以及导入Excel到R的问题
引入GEO DataSets上,某些Series是由多个series组成的,比如GSE6834,由六个Series组成:This SuperSeries is composed of the following SubSeries:Less… Less…GSE6771 Temporal Cortex Control (mesial temporal lobe epilepsy contr...原创 2019-01-04 01:40:24 · 13221 阅读 · 1 评论 -
R语言 使用getGEO()直接进行差异表达分析并显示Entrez_id和Symbol_id
引入平常我们利用GEODatasets的表达量数据进行基因表达分析的时候,常常是下载表达矩阵,利用limma包进行分析,如果能找到注释包,那就把探针注释成Entrez_id或者是Symbol_id,如果找不到,那就下载对应GPL提供的注释文件,但是很可能还是不好注释,比如今天拿来做例子的GSE15222对应的GPL2700:我们看到这个GPL只提供了GB_ACC也就是Genebank的一个号码...原创 2019-01-15 15:58:55 · 19543 阅读 · 6 评论