Java动态规划 实现最长公共子序列以及最长公共子字符串

动态规划法

经常会遇到复杂问题不能简单地分解成几个子问题，而会分解出一系列的子问题。简单地采用把大问题分解成子问题，并综合子问题的解导出大问题的解的方法，问题求解耗时会按问题规模呈幂级数增加。

为了节约重复求相同子问题的时间，引入一个数组，不管它们是否对最终解有用，把所有子问题的解存于该数组中，这就是动态规划法所采用的基本方法。

【问题】 求两字符序列的最长公共字符子序列

问题描述：字符序列的子序列是指从给定字符序列中随意地（不一定连续）去掉若干个字符（可能一个也不去掉）后所形成的字符序列。令给定的字符序列X=“x0，x1，…，xm-1”，序列Y=“y0，y1，…，yk-1”是X的子序列，存在X的一个严格递增下标序列<i0，i1，…，ik-1>，使得对所有的j=0，1，…，k-1，有xij=yj。例如，X=“ABCBDAB”，Y=“BCDB”是X的一个子序列。

考虑最长公共子序列问题如何分解成子问题，设A=“a0，a1，…，am-1”，B=“b0，b1，…，bm-1”，并Z=“z0，z1，…，zk-1”为它们的最长公共子序列。不难证明有以下性质：

（1） 如果am-1=bn-1，则zk-1=am-1=bn-1，且“z0，z1，…，zk-2”是“a0，a1，…，am-2”和“b0，b1，…，bn-2”的一个最长公共子序列；

（2） 如果am-1!=bn-1，则若zk-1!=am-1，蕴涵“z0，z1，…，zk-1”是“a0，a1，…，am-2”和“b0，b1，…，bn-1”的一个最长公共子序列；

（3） 如果am-1!=bn-1，则若zk-1!=bn-1，蕴涵“z0，z1，…，zk-1”是“a0，a1，…，am-1”和“b0，b1，…，bn-2”的一个最长公共子序列。

这样，在找A和B的公共子序列时，如有am-1=bn-1，则进一步解决一个子问题，找“a0，a1，…，am-2”和“b0，b1，…，bm-2”的一个最长公共子序列；如果am-1!=bn-1，则要解决两个子问题，找出“a0，a1，…，am-2”和“b0，b1，…，bn-1”的一个最长公共子序列和找出“a0，a1，…，am-1”和“b0，b1，…，bn-2”的一个最长公共子序列，再取两者中较长者作为A和B的最长公共子序列。

求解：

引进一个二维数组c[][]，用c[i][j]记录X[i]与Y[j] 的LCS 的长度，b[i][j]记录c[i][j]是通过哪一个子问题的值求得的，以决定搜索的方向。
我们是自底向上进行递推计算，那么在计算c[i,j]之前，c[i-1][j-1]，c[i-1][j]与c[i][j-1]均已计算出来。此时我们根据X[i] = Y[j]还是X[i] != Y[j]，就可以计算出c[i][j]。

问题的递归式写成：

回溯输出最长公共子序列过程：

 

算法分析：
由于每次调用至少向上或向左（或向上向左同时）移动一步，故最多调用(m * n)次就会遇到i = 0或j = 0的情况，此时开始返回。返回时与递归调用时方向相反，步数相同，故算法时间复杂度为Θ(m * n)。

Java代码实现：

[java]  view plain copy

1. public class LCSProblem   
2. {  
3.     public static void main(String[] args)  
4.     {  
5.         //保留空字符串是为了getLength()方法的完整性也可以不保留  
6.         //但是在getLength()方法里面必须额外的初始化c[][]第一个行第一列  
7.         String[] x = {"", "A", "B", "C", "B", "D", "A", "B"};  
8.         String[] y = {"", "B", "D", "C", "A", "B", "A"};  
9.           
10.         int[][] b = getLength(x, y);  
11.           
12.         Display(b, x, x.length-1, y.length-1);  
13.     }  
14.     /** 
15.      * @param x 
16.      * @param y 
17.      * @return 返回一个记录决定搜索的方向的数组 
18.      */  
19.     public static int[][] getLength(String[] x, String[] y)  
20.     {  
21.         int[][] b = new int[x.length][y.length];  
22.         int[][] c = new int[x.length][y.length];  
23.           
24.         for(int i=1; i<x.length; i++)  
25.         {  
26.             for(int j=1; j<y.length; j++)  
27.             {  
28.                 //对应第一个性质  
29.                 if( x[i] == y[j])  
30.                 {  
31.                     c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1;  
32.                     b[i][j] = 1;  
33.                 }  
34.                 //对应第二或者第三个性质  
35.                 else if(c[i-1][j] >= c[i][j-1])  
36.                 {  
37.                     c[i][j] = c[i-1][j];  
38.                     b[i][j] = 0;  
39.                 }  
40.                 //对应第二或者第三个性质  
41.                 else  
42.                 {  
43.                     c[i][j] = c[i][j-1];  
44.                     b[i][j] = -1;  
45.                 }  
46.             }  
47.         }     
48.           
49.         return b;  
50.     }  
51.     //回溯的基本实现，采取递归的方式  
52.     public static void Display(int[][] b, String[] x, int i, int j)  
53.     {  
54.         if(i == 0 || j == 0)  
55.             return;  
56.           
57.         if(b[i][j] == 1)  
58.         {  
59.             Display(b, x, i-1, j-1);  
60.             System.out.print(x[i] + " ");  
61.         }  
62.         else if(b[i][j] == 0)  
63.         {  
64.             Display(b, x, i-1, j);  
65.         }  
66.         else if(b[i][j] == -1)  
67.         {  
68.             Display(b, x, i, j-1);  
69.         }  
70.     }  
71. }  

最长公共子字符串：类似最长子序列，只是公共子字符串要求必须是连续的。
java实现代码如下：

[java]  view plain copy

1. public class stringCompare {  
2.     //在动态规划矩阵生成方式当中，每生成一行，前面的那一行就已经没有用了，因此这里只需使用一维数组，而不是常用的二位数组  
3.     public static void getLCString(char[] str1, char[] str2) {  
4.         int len1, len2;  
5.         len1 = str1.length;  
6.         len2 = str2.length;  
7.         int maxLen = len1 > len2 ? len1 : len2;  
8.   
9.         int[] max = new int[maxLen];// 保存最长子串长度的数组  
10.         int[] maxIndex = new int[maxLen];// 保存最长子串长度最大索引的数组  
11.         int[] c = new int[maxLen];  
12.   
13.         int i, j;  
14.         for (i = 0; i < len2; i++) {  
15.             for (j = len1 - 1; j >= 0; j--) {  
16.                 if (str2[i] == str1[j]) {  
17.                     if ((i == 0) || (j == 0))  
18.                         c[j] = 1;  
19.                     else  
20.                         c[j] = c[j - 1] + 1;//此时C[j-1]还是上次循环中的值，因为还没被重新赋值  
21.                 } else {  
22.                     c[j] = 0;  
23.                 }  
24.   
25.                 // 如果是大于那暂时只有一个是最长的,而且要把后面的清0;  
26.                 if (c[j] > max[0]) {  
27.                     max[0] = c[j];  
28.                     maxIndex[0] = j;  
29.   
30.                     for (int k = 1; k < maxLen; k++) {  
31.                         max[k] = 0;  
32.                         maxIndex[k] = 0;  
33.                     }  
34.                 }  
35.                 // 有多个是相同长度的子串  
36.                 else if (c[j] == max[0]) {  
37.                     for (int k = 1; k < maxLen; k++) {  
38.                         if (max[k] == 0) {  
39.                             max[k] = c[j];  
40.                             maxIndex[k] = j;  
41.                             break; // 在后面加一个就要退出循环了  
42.                         }  
43.                     }  
44.                 }  
45.             }  
46.             for (int temp : c) {  
47.                 System.out.print(temp);  
48.             }  
49.             System.out.println();  
50.         }  
51.         //打印最长子字符串  
52.         for (j = 0; j < maxLen; j++) {  
53.             if (max[j] > 0) {  
54.                 System.out.println("第" + (j + 1) + "个公共子串:");  
55.                 for (i = maxIndex[j] - max[j] + 1; i <= maxIndex[j]; i++)  
56.                     System.out.print(str1[i]);  
57.                 System.out.println(" ");  
58.             }  
59.         }  
60.     }  
61.   
62.     public static void main(String[] args) {  
63.   
64.         String str1 = new String("binghaven");  
65.         String str2 = new String("jingseven");  
66.         getLCString(str1.toCharArray(), str2.toCharArray());  
67.     }  
68. } 

给定字符序列a 和 b 问a是否是b的子序列

/** * 判断a是否是b的子序列 * @param a * @param b * @return */ public static boolean isLCS(String a,String b){ int j = 0; for (int i = 0; i < b.length(); i++) { if (b.charAt(i) == a.charAt(j)) { j++; // 相等的话，指针右移一位 if (j >= a.length()) { return true; } } } return false; }