1. K-means算法的非形式化描述
非定一个N个对象的集合，要将这些对象分组到K个簇中，k-means算法需要完成以下
步骤：
1） 将N个对象划分到K个非空子集。
2） 计算当前分区中心的簇质心（质心是这个簇的中心点或平均点）。
3） 将各个对象分配到有最近质心的簇。
4） 如果不在有新的分配，则停止计算。否则返回步骤2.。
这个算法会反复迭代，直到质心不再发生改变，此时就找到了我们想要的K个簇。
2.K-means均值距离函数
采用欧式距离，即设二维平面上两点a(x1,y1)与b(x2,y2)间的欧氏距离为：
3. MapReduce的解决方案
1.main函数读取质心文件
2. 将质心的字符串放到configuration中
3. 在mapper类重写setup方法，获取到configuration的质心内容，解析成二维数组的形式，代表质心
4. mapper类中的map方法读取样本文件，跟所有的质心比较，得出每个样本跟哪个质心最近，然后输出<质心，样本>
5. reducer类中重新计算质心，如果重新计算出来的质心跟进来时的质心一致，那么自定义的counter加1
6. main中获取counter的值，看是否等于质心数量，如果不相等，那么继续迭代，否则退出
3.1 预备阶段（读取簇质心文件）
分两种读取，一种是第一次读取客户给定的簇质心文件，另一种是读取reduce输出的簇质心文件public class Center {
protected static int k = 2; //质心的个数 ，每次都输出两个质心
//拿到初始的保存在hdfs文件中的初始质心
public String loadInitCenter(Path path) throws Exception{
StringBuffer sb = new StringBuffer();
Configuration conf = new Configuration();
FileSystem fs = FileSystem.get(new URI("hdfs://example:9000"),conf,"hadoop");
FSDataInputStream din = fs.open(path); //往目标文件上兑一根输入流
LineReader in = new LineReader(din,conf);//包装
Text line = new Text();
while(in.readLine(line) > 0){//读到的一行数据放入line对象中，若其长度大于0
sb.append(line.toString().trim());//则保存进buffer中
sb.append("\t");//用\t间隔
}
return sb.toString().trim();
}
//拿到后来reduce重新生成的质心
public String loadCenter(Path path)throws Exception{
//sb中保存每个文件中的k个质心，每个质心用\t隔开
StringBuffer sb = new StringBuffer();
Configuration conf = new Configuration();
FileSystem fs = FileSystem.get(conf);
//拿到reduce输出目录下的所有文件
RemoteIterator<LocatedFileStatus> files = fs.listFiles(path, false);
while(files.hasNext()){
LocatedFileStatus lfs = files.next();
//过滤掉非簇质心所在文件
if(!lfs.getPath().getName().contains("part"))
continue;
FSDataInputStream din = fs.open(lfs.getPath());
LineReader in = new LineReader(din);
Text line = new Text();
while(in.readLine(line) > 0){
sb.append(line.toString().trim());
sb.append("\t");
}
}
return sb.toString().trim();
}
}
3.2 Mapper阶段
1）在预处理阶段去拿到给定的初始簇质心（setup方法）
2）对文件中读到的每行“向量” 拿出来计算与每个质心之间的距离
3）保存与输入点有最小距离的簇质心
4）输出键是离输入点最近的簇质心 值是该向量
static class K_meansMapper extends Mapper<LongWritable, Text, Text, Text>{
String centerStrArray[] = null; //每个元素代表一个簇质心d维坐标的字符串，之间用“，”隔开
double centers[][] = new double[Center.k][];//每个元素代表一个簇质心在d维空间中某一维的坐标
//预处理，收集初始簇质点；
@Override
protected void setup(Context context)
throws IOException, InterruptedException {
//得到上一轮聚类后的簇质心
String centerSource = context.getConfiguration().get(FLAG);
System.out.println(centerSource);
centerStrArray = centerSource.split("\t"); //得到所有簇质心组成的字符串数组
for(int i=0;i<centerStrArray.length;i++){
String centerStr[] = centerStrArray[i].split(",");//得到每个质心的维度坐标的字符串数组
centers[i] = new double[centerStr.length];
for(int j=0;j<centerStr.length;j++){
centers[i][j] = Double.parseDouble(centerStr[j]);
}
}
}
//
@Override
protected void map(LongWritable key, Text value,Context context)
throws IOException, InterruptedException {
String line = value.toString();
String vector[] = line.split(",");
double sample[] = new double[vector.length];
for(int i=0;i<vector.length;i++){
sample[i] = Double.parseDouble(vector[i]);
}
double min = Double.MAX_VALUE;//记录最小距离
int index = 0;//记录最小距离的簇质点
//计算每个输入点与簇质心的距离，并且找出距离当前点的最近簇质心
for(int i=0;i<centers.length;i++){
double d = distance(sample,centers[i]);
if(min > d){
min = d;
index = i;
}
}
//输出<簇质点，向量>
context.write(new Text(centerStrArray[index]), value);
}
}
3.3 Combiner阶段
各个映射任务之后，会应用combiner来组合映射任务的中间数据。组合器将累加向量对象的各个维的值，并计算当前的平均值。Combine()函数是在map阶段输出后，临时内存中数据溢出时开始执行，故其相当于是在本地做了合并，然后将合并的值通过网络传输给reduce，这样一来就可以充分的减少网络传输流量，从而提高算法的执行效率。
static class K_meansCombinner extends Reducer<Text, Text, Text, Text>{
@Override
protected void reduce(Text key, Iterable<Text> values,Context context)
throws IOException, InterruptedException {
int len = key.toString().split(",").length;
double center[] = new double[len];
int size = 0;
Iterator<Text> iterator = values.iterator();
while(iterator.hasNext()){
String centerStr[] = iterator.next().toString().split(",");
for(int i=0;i<len;i++){
center[i] += Double.parseDouble(centerStr[i]);
}
size++;
}
StringBuffer sb = new StringBuffer();
for(int i=0;i<center.length;i++){
center[i] /= size;
sb.append(center);
sb.append(",");
}
sb.deleteCharAt(sb.toString().length() - 1);
context.write(key, new Text(sb.toString()));
}
}
3.4 Reducer阶段
1）重新计算簇中心
2）每个归约器迭代处理各个值向量，计算其平均值。将计算好的平均值当做下一个簇中心，并输出
3）比较新质点与老质点，若小于阙值则将自定义的counter加1
static class K_meansReducer extends Reducer<Text, Text, Text, NullWritable>{
Counter counter = null;
@Override
protected void reduce(Text key, Iterable<Text> values,Context context)
throws IOException, InterruptedException {
int len = key.toString().split(",").length;
double newCenter[] = new double[len]; //保存新生成的簇中心
int size = 0; //记录传过来的簇中有多少向量
for(Text value : values){
String centerStr[] = value.toString().split(",");//拿到所有d维空间中的“点”信息
for(int i=0;i<centerStr.length;i++){//将其对应的空间轴坐标累加，方便后面求均值
newCenter[i] += Double.parseDouble(centerStr[i]);
}
size++;
}
//由StringBuffer保存的新的聚类簇的质心坐标
StringBuffer sb = new StringBuffer();
for(int i=0;i<newCenter.length;i++){
newCenter[i] /= size;//求平均值
sb.append(newCenter[i]);
sb.append(",");
}
sb.deleteCharAt(sb.toString().length()-1);
//拿到由map传过来的上一轮产生的簇质心坐标
String oldCenterStr[] = key.toString().split(",");
double oldCenter[] = new double[oldCenterStr.length];
for(int i=0;i<oldCenterStr.length;i++){
oldCenter[i] = Double.parseDouble(oldCenterStr[i]);
}
//新质心同老质心比是否发生变化
boolean flag = changed(oldCenter,newCenter);
//若有变化则将计数器+1, 代表已经由一个最终簇的质心确定
if(flag){
//第一个是计数器组的名称，第二是计数器的名称
counter = context.getCounter("myCounter", "kmenasCounter");
counter.increment(1l);
}
context.write(new Text(sb.toString().trim()), NullWritable.get());
}
}3.5 辅助方法
主要包括两个，一个是判断新老质心的改变是否收敛，另一个是欧氏距离函数
//两组质心的改变是否收敛
public static boolean changed(double oldCenter[],double newCenter[]){
for(int i=0;i<oldCenter.length;i++){
if(oldCenter[i] - newCenter[i] > 0.0000001){
return false;
}
}
return true;
}
//欧氏距离
public static double distance(double center[],double data[]){
double sum = 0;
for(int i=0;i<center.length;i++){
sum += Math.pow(center[i]-data[i], 2);
}
return Math.sqrt(sum);
}3.5 main方法
1）决定输出输入目录
2）读入文件中的簇质心信息，并将其转换为字符串放入configuration中
3）通过自定义的counter控制迭代次数
public static void main(String[] args) throws Exception {
Path inputPath = new Path("/kmeans/input");
Path centerPath = new Path("/kmeans/output/center.txt");
Center center = new Center();
String centerStr = center.loadInitCenter(centerPath); //拿到初始化的质心
int index = 0;
while(true){
Configuration conf = new Configuration();
conf.set(FLAG, centerStr);//将其放入Configuration中
//将初始化的质心目录改为reduce的输出目录，也是下一轮的质心所在目录
centerPath = new Path("/kmeans/output"+index);
Job job = Job.getInstance(conf, "kmeans" + index);
job.setJarByClass(K_means.class);
job.setMapperClass(K_meansMapper.class);
job.setReducerClass(K_meansReducer.class);
job.setCombinerClass(K_meansCombiner.class);
job.setMapOutputKeyClass(Text.class);
job.setMapOutputValueClass(Text.class);
job.setOutputKeyClass(Text.class);
job.setOutputValueClass(NullWritable.class);
FileInputFormat.setInputPaths(job, inputPath);
FileOutputFormat.setOutputPath(job, centerPath);
//提交
job.waitForCompletion(true);
//★★★★
//获取自定义counter的大小，若等于k值则说明已经得到最终结果
//"myCounter", "kmenasCounter"
Counter counter = job.getCounters().getGroup("myCounter").findCounter("kmenasCounter");
long countValue= counter.getValue();
if(countValue == Center.k)
System.exit(0);
else{
//若程序未退出，则重新加载reduce输出的新质心 ，此时不再用初始化加载
counter.setValue(0l);
centerStr = center.loadCenter(centerPath);
index++;
}
}
}
4.输入与输出
实例样本：
1,1
2,2
3,3
-3,-3
-4,-4
-5,-5 初始质心：
1,1
2,2 聚类结果：
-4.0，-4.0
2.0，2.0参考博客： http://blog.csdn.NET/nwpuwyk/article/details/29564249?utm_source=tuicool&utm_medium=referral
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