poj 1080

2015/2/13

说不出来是什么dp。。

问在给定矩阵条件的情况下两字符串的最优匹配程度。

那就类似最长公共子序列了...（虽然这样说没有一点科学依据但是你砍我啊！）

字符串s1 和字符串s2 

for-> i s1

for->j  s2

去遍历匹配，需要注意的是两者都可以匹配这个玩意  ‘  -  ’ 

所以在匹配的时候需要判断下 （s1[ i ] - ' - ' 和 ' - '  -  s2[ j ]  这样连接时不同的情况看过题目的就明白了）

#include<map>
#include<queue>
#include<stack>
#include<cmath>
#include<vector>
#include<climits>
#include<stdio.h>
#include<string.h>
#include<iostream>
#include<algorithm>

using namespace std;
typedef long long ll;  

#define mod 10007
#define lson pos<<1,l,mid
#define sc(n) scanf("%d",&n)
#define rson pos<<1|1,mid+1,r
#define pr(n) printf("%d\n",n)
#define met(n,m) memset(n, m, sizeof(n))
#define F(x,y,i) for(int i = x;i > y; i--)
#define f(x,y,i) for(int i = x;i < y; i++)
#define ff(x,y,i) for(int i = x;i <= y; i++)
#define FF(x,y,i) for(int i = x;i >= y; i--) 

const int N=100500;
const int inf = INT_MAX;

int Max(int a,int b)
{
	return a>b?a:b;
}

int Min(int a,int b)
{
	return  a<b?a:b;
}

int len1,len2;

char s1[1005],s2[1005];

int tp[5][5]={   
    5,-1,-2,-1,-3,  
    -1,5,-3,-2,-4,  
    -2,-3,5,-2,-2,  
    -1,-2,-2,5,-1,  
    -3,-4,-2,-1,0  
};

map<char,int> mp;

 

int dp[105][105];

int main()  
{  
    int n, m, tot, x;
    
    mp['A']= 0, mp['C']=1, mp['G']=2, mp['T']=3, mp['-'] = 4;
    
	scanf("%d",&tot);

    while(tot--)
    {
    	scanf("%d%s",&len1,s1+1);
    	scanf("%d%s",&len2,s2+1);
		dp[0][0] = 0;
		
		f(1,len1+1,i)
		dp[i][0] = tp[mp[s1[i]]][mp['-']] + dp[i-1][0];    	
    	
    	f(1,len2+1,i)
    	dp[0][i] = tp[mp['-']][mp[s2[i]]]+dp[0][i-1];
    	
    	f(1,len1+1,i)
    	f(1,len2+1,j)
    	{
	    	dp[i][j] = dp[i-1][j-1] + tp[mp[s1[i]]][mp[s2[j]]];
	    	dp[i][j] = Max(dp[i][j] , dp[i-1][j] + tp[mp[s1[i]]][mp['-']]	);
	    	dp[i][j] = Max(dp[i][j] , dp[i][j-1] + tp[mp['-']][mp[s2[j]]]	);
	    }
    	printf("%d\n",dp[len1][len2]);
    }
    return 0;  
}