MongoDB必备基本操作

目录

1.查询

2.插入

联合其他表插入

3.修改update

---

1.查询

db.collection.find({查询条件},{返回信息})

1）查询条件

db.collection.find({"筛选字段":筛选值})

db.collection.find({ "pmid":{$gt:0},{"": } })

$操作符

$ne 不等于

$gt 大于

db.abc_literature.find({ 
    "year": { "$exists": true },
    "$expr": { "$gt": [ { "$strLenCP": "$year" }, 4] } 
})

长度＜4
db.abc_literature.find({ 
    "year": { "$exists": true },
    "$expr": { "$lt": [ { "$strLenCP": "$year" }, 4] } 
})

包含

数组长度：

db.abc_literature_relation.find({'$where':'this.institution_info.length>1'}).count();

2）返回信息

{"返回字段":1,"不返回字段":0}

db.colleciton.find({},{"_id":0,"pmid":1})

数组类型查询：

数组存在但是为0：

db.abc_literature_relation.find({"strain_info":{$elemMatch:{$ne:null}}}).count();

db.abc_literature_relation.find({"strain_info":{$size: 0}});

3）聚类查询$group

切分：$unwind

eg: author为Array类型

db.abc_literature.aggregate([
  { $unwind:"$author" },
  { $group: { _id:"$author.Affiliation", count: { $sum : 1} }},
    { $sort:{count:-1}}
]);

4）带条件的聚类查询：

db.abc_literature.aggregate([
    { $match: {"journal.issn": {"$ne":""} }},
  { $group: { _id:"$journal.journaltitle", count: { $sum : 1 } } },
    { $sort:{count:-1}}
]);

5）聚类时，超出内存：

//处理author和athors一致后：超出内存
db.abc_literature_relation.aggregate(

[ { $unwind:"$scholar_info"},
    { $unwind:"$scholar_info.affiliation"},
    { $group: { _id:"$scholar_info.affiliation", count: { $sum : 1 } } },
    { $sort:{count:-1}}],
{ allowDiskUse: true });

由于MongoDB区分大小写，聚类不区分大小写时：
db.abc_dict_strain.aggregate([
    { $group: { _id:{ $toLower:"$strain_number" }, count: { $sum : 1 } } },
    { $sort:{count:-1}}
],
{ allowDiskUse: true });

6)模糊查询、不区分大小写、正则查询

//查询包含字符串：
//正则表达http://edu.jb51.net/mongodb/mongodb-regular-expression.html
>db.posts.find({post_text:{$regex:"edu.jb51.net"}})
或者/匹配字符串/
>db.posts.find({post_text:/edu.jb51.net/})
不区分大小写
db.posts.find({post_text:{$regex:"edu.jb51.net",$options:"$i"}})

2.插入

db.abc_literature.insert({"pmid":123,"title":"test",...},options)

db.abc_literature.insertMany([{"pmid":123,"title":"test",...},{}],options)

//插入菌株
db.abc_dict_strain.insertOne({
"strain_number":'ATCC 22752',
"strain_name":'Absidia glauca',
"taxid":4829,
"wdcm_number":496});
 

联合其他表插入

3.修改update

批量修改updateMany

updateMany({修改对象的筛选条件：条件值}，{$set:{修改属性:修改值}})

//multi是否更新多条,(upsert是直接插入)
//db.abc_literature_test.update({"pmid":''},{$set:{"pmid":NumberInt(0)}},{multi: true});

更新数组字段 指定的信息

使用 .$. 表示筛选条件查找的具体的对象 

relation_coll.update_one({"_id":rl["_id"],"institution_info.inst_id":wrong_id},{"$set":{"institution_info.$.inst_id":corrct_id}})