网络分析
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金子哦
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R语言网络分析2:graph函数和应用
产生网络自定义BioC 中用得最多的网络类型可能是 graphNEL 类。使用 graphNEL 类的同名函数可以产生自定义网络: library(graph) str(graphNEL)#> function (nodes = character(), edgeL = list(), edgemode = "undirected") nds <- letters[1:3] gx1 <- graphNEL(nodes = nds, edgemode =原创 2021-02-22 11:22:15 · 5387 阅读 · 0 评论 -
R语言网络分析1:BioC的graph图系
BioC项目中,网络图的处理通过不同的软件包进行:graph:图实现方法、类定义(graphNEL、graphAM和graphBAM)和基本函数 RBGL:针对BioC graph类对象提供Boost图算法接口函数,如最短路径、最大流量、连通性等 gRbase:提供了bgraph和igraph图间的转换函数(as),生成网络函数比graph的函数更好用 Rgraphviz:graph对象的渲染,包括布局算法和图形可视化参数图的类型与生成graphNEL类由node和edge列表(NEL)原创 2021-02-10 21:26:23 · 2416 阅读 · 0 评论