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原创 pd.csv()

panda.read_csv()函数用法。该函数将CSV文件(逗号分割)转换为dataframe,并去掉第一行,重新命名每列的列名。参数中的names就是重新命名的列名。如原evec文件打开pcaDat对象打开:两者之间只有每列的标题不同。

2022-11-14 12:50:18 479

原创 Python打开文本文件时报错UnicodeDecodeError: ‘gbk‘ codec can‘t decode byte 0xbf in position 2: illegal multiby

代码】Python打开文本文件时报错UnicodeDecodeError: 'gbk' codec can't decode byte 0xbf in position 2: illegal multiby。

2022-08-07 16:13:03 2202

原创 如何看一篇文章的分数

以sci为例,一篇文章的分数其实就看他发表在几分的杂志上,杂志几分,文章就算几分。进入文章页面拉到底,就能看见文章发在哪个杂志上,多少分了。

2022-03-13 16:17:53 4071

原创 upset图形如何理解

upsetR是除了韦恩图之外另一种集合可视化的方法。一般集合不超过5个的时候,可视化效果还是不错的,但是集合超过五个时,你就很难从图中解读出想要的信息了。这是我们可以使用upsetR包来进行处理。upset图要结合柱子和点一起来看。首先我们导入的数据为list <- list(Heart=rownames(subset(d1, group=='Network')), Muscle=rownames(subset(d2, group=='Network')), Lung=rownam..

2022-03-04 13:58:11 11358 3

原创 apply、lapply、sapply 与parApply、parApply、parSapply的区别

parApply、parApply、parSapply是parallel包里面的apply、lapply、sapply是base包里面自带的。parApply、parApply、parSapply分别是apply、lapply、sapply的并行运算版本。对应的方法输出结果和使用方式相同,是不过par-需要设定核数(或者使用默认核数计算)margin目录1.apply 对象为数组Apply Functions Over Array MarginsDescription...

2021-12-16 14:10:36 2131

原创 R函数的存储与载入

直接将一个函数存为一个R文件,使用时直接用source()载入即可这是我的函数R文件 命名为createdir.Rcreatedir<-function(){mainDir <- getwd()subDir <- c("predata","Network",'Gene_Peak',"GPPair","Cicero","Accessibility")for(i in subDir){ if (!file.exists(i)){ dir.create(file..

2021-12-16 11:53:35 925

原创 A version of this package for your version of R might be avai7ab1e elsewhere,

A version of this package for your version of R might be availab1e elsewhere,尝试加载BioManagerlibrary(BiocManager)install('GEOquery')

2021-10-02 16:52:11 12739 2

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