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原创 GEO数据挖掘-DAY1
总而言之,使用降维的算法,自定义坐标轴——把多个指标转化为少数几个综合指标(即主成分),根据这些主成分进行样本聚类,进而实现样本组内/组间的差异可视化。boxplot(exp,las = 2) #看是否有异常样本(跟其他样本截然不同),还要看纵坐标有无log (纵坐标范围在2-4之间大概率是取重复了)view(pd) #一般看title这一列(也可能是在别的列),哪些是实验组,哪些是对照组,并找到提取的关键词。#(4)提取芯片平台编号,后面要根据它来找探针注释。
2024-03-18 13:53:09
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空空如也
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