基因的庇护 (AC自动机 dp)

基因的庇护

10.25

思路:
一道比较典型的AC自动机上DP,只不过需要分析一下性质。
由于每个位置都需要被庇护序列覆盖到,用dp[i][j][k]表示链长为i,在AC自动机上的j号点,当前链上倒数第k个位置是最左的没有被覆盖到的位置时的方案数。预处理出AC自动机上每个结点表示的串的最长的有庇护效应的后缀长度,转移时就看这个长度是否大于等于k+1,若大于等于则说明倒数第k个位置能被覆盖到了,即转移到dp[i+1][j'][0];否则转移到dp[i+1][j'][k+1]。
把dp[n][j][0]求和即为答案。
做不完的题,想不到的dp。。。

#include <iostream>
#include <cstdio>
#include <cstring>
#include <algorithm>
#define N 105
#define MOD 1000000009
using namespace std;

int n, m, tot;
int head, tail;
char s[20];
int to[N][4], fail[N], cover[N];
int dp[1005][N][12], q[N];

inline void add(int &a, const int &b){
    a += b;
    if(a >= MOD) a -= MOD;
}

int re(char x){
    if(x == 'A') return 0;
    if(x == 'T') return 1;
    if(x == 'C') return 2;
    if(x == 'G') return 3;
}

void insert(){
    int p = 0;
    int len = strlen(s+1);
    for(int i=1; i<=len; ++i){
        if( !to[p][re(s[i])] ) to[p][re(s[i])] = ++tot;
        p = to[p][re(s[i])];
    }
    cover[p] = len;
}

void get_fail(){
    for(int i=0; i<4; ++i) if( to[0][i] ) q[tail++] = to[0][i];
    while(head < tail){
        int a = q[head++];
        for(int i=0; i<4; ++i){
            if( to[a][i] ){
                fail[to[a][i]] = to[fail[a]][i];
                q[tail++] = to[a][i];
                cover[to[a][i]] = max(cover[to[a][i]], cover[fail[to[a][i]]]);
            }
            else to[a][i] = to[fail[a]][i];
        }
    }
}

void solve(){
    dp[0][0][0] = 1;
    for(int i=0; i<n; ++i){
        for(int j=0; j<=tot; ++j){
            for(int k=0; k<10; ++k){
                if( !dp[i][j][k] ) continue;
                for(int p=0; p<4; ++p){
                    int v = to[j][p];
                    if(cover[v] >= k+1) add(dp[i+1][v][0], dp[i][j][k]);
                    else add(dp[i+1][v][k+1], dp[i][j][k]);
                }
            }
        }
    }
    int ans = 0;
    for(int i=0; i<=tot; ++i) add(ans, dp[n][i][0]);
    printf("%d\n", ans);
}

int main(){
    freopen("protect.in", "r", stdin);
    freopen("protect.out", "w", stdout);
    scanf("%d%d", &n, &m) ;
    for(int i=1; i<=m; ++i){
        scanf("%s", s+1) ;
        insert();
    }
    get_fail();
    solve();
    return 0;
}
  • 0
    点赞
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值