freesurfer:
freesurfer好安装,只需要下载官网源码包,如freesurfer5.3.tar.gz
下载至本地,解压:
tar zxvf freesurfer5.3.tar.gz -C /software/freesurfer5.3
其中,-C选项能够设置解压路径
然后只需要在本地用户的.bashrc下设置freesurfer变量即可:
gedit ~/.bashrc:
export FREESURFER_HOME=/software/freesurfer5.3
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
export PATH=/software/freesurfer5.3/bin:$PATH
fsl:
ubuntu下安装见官网
Centos系统下安装过程:
网络正常时,直接运行fslinstaller.py文件:
./fslinstaller.py或者python fslinstaller.py