医学图像处理
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灰度图像的空洞填充(孔洞填充)opencv-python
做项目需要对灰度图像进行空洞填充,但是网上全都是关于灰度图像的空洞填充,我的图像内容包含重要信息,所以不能转化为灰度图像.代码如下:import numpy as npimport scipy as spimport scipy.ndimagedef fill(test_array,h_max=255): input_array = np.copy(test_array) el = sp.ndimage.generate_binary_structure(2,2).ast原创 2020-07-26 16:23:25 · 4511 阅读 · 9 评论 -
超简单的3D slicer使用教程(四)Buliding Model和保存
接下来,要学习Buliding Model:因为我们之前创建标签的时候,标明了两种颜色,所以我们可以创建两个模型:我们选择倒数第二个按钮,也就是makemodleeffect按钮:然后选择我们之前所标注的颜色,先形成之前黄色的区域:然后在apply就可以了:然后就可以看到黄色的模型出现:同理,我们可以在创建绿色的模型:在上述一系列操作之后,就完成了...原创 2020-05-05 18:48:59 · 5730 阅读 · 1 评论 -
超级简单的3D slicer教程(三)creating label Map
接着之前的部分,今天我们要学习的是creating label Map.首先,我们要关闭ROI的显示,把小眼睛关了就可以:于此同时,展示区域的ROI框也消失:然后我们在将模块换为volume rendering,并且关闭显示:然后再选择editor模块,会出现以下信息:大概意思就是:要在剪切文件上创建一个标签文件,并且选择颜色模式。直接选择ok就行:...原创 2020-05-05 18:25:05 · 3697 阅读 · 0 评论 -
超级简单的3D slicer教程(二)Crop 剪裁
在了解了界面的基本操作之后,我们这一次来学习数据加载。用这个软件加载数据也非常简单,直接拖到右边的显示界面就可以显示了,如果手头没有文件,可以从软件提供的下载。就在欢迎界面的这个部分。这里包含了很多例子,可以直接点击进行下载,由于网址是外网,下载非常慢,并且软件会出现卡顿的情况,如果有条件可以直接用梯子,这里我教大家一个超级简单的方法,那就是手机开热点,百试百灵!下载完成就会自动显示再...原创 2020-05-05 17:23:22 · 8941 阅读 · 5 评论 -
超级简单的3D slicer使用教程(一)
接触此软件的对他应该是有几个基本了解了,话不多说,直接来介绍用法吧。1.界面基本介绍一打开界面应该是这个样子:这是外国人开发的软件,所以是英文界面也没有什么疑问,而且这软件多用与医学领域,所以也不是特别热门,所以也暂时没有汉化,所以对于一些英文不是特别好的同学还是有点困难的,但是只要认识一些基本词汇,比如model这些,使用此软件还是没什么问题的。首先就是基本的操作界面,或者我...原创 2020-05-05 14:47:58 · 31973 阅读 · 10 评论