一种Playfair密码变种加密方法如下：首先选择一个密钥单词（称为pair）（字母不重复，且都为小写字母），然后与字母表中其他字母一起填入至一个5x5的方阵中，填入方法如下1.首先按行填入密钥串。2

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一种Playfair密码变种加密方法如下：首先选择一个密钥单词（称为pair）（字母不重复，且都为小写字母），然后与字母表中其他字母一起填入至一个5x5的方阵中，填入方法如下：
1.首先按行填入密钥串。
2.紧接其后，按字母序按行填入不在密钥串中的字母。
3.由于方阵中只有25个位置，最后剩下的那个字母则不需变换。
如果密钥为youandme，则该方阵如下：  
y o u a n
d m e b c
f g h i j
k l p q r
s t v w x
在加密一对字母时，如am，在方阵中找到以这两个字母为顶点的矩形：
o u a
m e b

这对字母的加密字母为该矩形的另一对顶点，如本例中为ob。
请设计程序，使用上述方法对输入串进行加密，并输出加密后的串。
另外有如下规定：
1、一对一对取字母，如果最后只剩下一个字母，则不变换，直接放入加密串中；
2、如果一对字母中的两个字母相同，则不变换，直接放入加密串中；
3、如果一对字母中有一个字母不在正方形中，则不变换，直接放入加密串中；
4、如果字母对出现在方阵中的同一行或同一列，如df或hi，则只需简单对调这两个字母，即变换为fd或ih；
5、如果在正方形中能够找到以字母对为顶点的矩形，假如字母对为am，则该矩形的另一对顶点字母中，
与a同行的字母应在前面，在上例中应是ob；同样若待变换的字母对为ta，则变换后的字母对应为wo；
6、本程序中输入串均为小写字母，并不含标点、空格或其它字符。
解密方法与加密相同，即对加密后的字符串再加密，将得到原始串。
要求输入形式如下：
从控制台输入两行字符串，第一行为密钥单词（长度小于等于25），第二行为待加密字符串（长度小于等于50），
两行字符串末尾都有一个回车换行符，并且两行字符串均为小写字母，不含其它字符。
在标准输出上输出加密后的字符串。
例如，若输入：
youandme
welcometohangzhou
则表示输入的密钥单词为youandme，形成的正方形如上所示；待加密字符串为welcometohangzhou。
在正方形中可以找到以第一对字母we为顶点的矩形，对应另一对顶点字母为vb，因此加密后为vb，
同理可找到与字母对lc,et,oh,ho对应的顶点字母对。而字母对om位于上述正方形中的同一列，所以直接以颠倒这两个字母来加密，即为mo，
字母对an同理。字母对gz中的z不在上述正方形中，因此原样放到加密串中。最后剩一个字母u也原样输出。
因此输出的结果为：
vbrmmomvugnagzguu


 */
import java.util.ArrayList;
import java.util.List;
import java.util.Scanner;

public class 矩阵变换加密法 {
	static char[][] cArr = new char[5][5];
	static List
  
  
   
    clist = new ArrayList
   
   
    
    ();

	public static void main(String[] args) {
		String s = new Scanner(System.in).nextLine();

		for (char c = 'a'; c <= 'z'; c++) {
			clist.add(c);
		}
		产生密钥(s);

	}

	private static void 产生密钥(String s) {

		char[] c = s.toCharArray();
		for (int i = 0; i < c.length; i++) {
			clist.remove((Character) c[i]);

		}//若clist中包含密钥，去除密钥中的字母。
		StringBuffer sb = new StringBuffer();//拼接密钥中的25个字母，最后转换成二维数组
		for (int i = 0; i < c.length; i++) {
			sb.append(c[i]);
		}
		for (int i = 0; i < 25 - c.length; i++) {
			sb.append(clist.get(i));
		}
		for(int i = 0;i<5;i++){
			for(int j = 0;j<5;j++){
				cArr[i][j] = sb.toString().charAt(i*5+j);
			}
		}//转换为二位数组
		
		for(int i = 0;i<5;i++){
			for(int j = 0;j<5;j++){
				System.out.print(cArr[i][j]);
			}
			System.out.println();
		}//打印密钥二维数组
		
		System.out.println("请输入要加密的字符串：");
		String str = new Scanner(System.in).nextLine();//要加密的字符串
		char[][] strArr = strArr =  new char[str.length()/2][2] ;
		
			
			
			
			for(int i = 0 ;i<str.length()/2;i++){
				for(int j = 0;j<2;j++){
					strArr[i][j] = str.charAt(i*2 + j);
				}
			}
			//将要加密的字符串转换为二维数组
			
		
		StringBuffer sb2 = new StringBuffer();
		for(int i = 0;i<str.length()/2;i++){
			char[]  strLine = strArr[i];
			char a = strLine[0];
			char b = strLine[1];
			
			int x1 = 0;
			int y1 = 0;
			int x2 = 0;
			int y2 = 0;
			/
			if(sb.toString().contains(a+"")&&sb.toString().contains(b+"")){//如果包含在密钥中
			   for(int x = 0;x<cArr.length;x++){//
			    	for(int y = 0;y<cArr.length;y++){
				    	if(cArr[x][y]==a){
				    		x1 = x;//取出a和b的坐标
				    		y1 = y;
				    	}
				    	
				    	if(cArr[x][y]==b){
				    		x2 = x;
				    		y2 = y;
				    	}
				    }
			    	
			    }
				if(x1!=x2&&y1!=y2){//不在同一行或者同一列
					 
				    sb2.append(cArr[x1][y2]);
				    sb2.append(cArr[x2][y1]);
					}else if(x1==x2||y1==y2){
						sb2.append(b);
						sb2.append(a);
					}
				
			}else{//包含在其中，并且不在同一行，不在同一列，那也就是说两个字母可能相同，可能在同一行或者同一列
				sb2.append(a);
				sb2.append(b);
			}
			
			   //
		
		    
		}
		if(str.length()%2!=0){//若为基数，应该加上最后一个字母。因为声明数组strArr的时候长度是strArr[str/2][2]
			sb2.append(str.substring(str.length()-1));
		}
		System.out.println(sb2.toString());
	}
}

运行结果：
youandme
youan
dmebc
fghij
klpqr
stvwx
请输入要加密的字符串：
welcometohangzhou

vbrmmomvugnagzguu